More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0888 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 251 aa  507  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  57.78 
 
 		 226 aa  255  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  54.46 
 
 		 238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  53.71 
 
 		 225 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  52.4 
 
 		 225 aa  218  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  52.4 
 
 		 225 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  53.97 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  45.19 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  46.85 
 
 		 237 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  43.59 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  39.22 
 
 		 232 aa  174  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  43.97 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  44.73 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  45.26 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  38.24 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  38.1 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  37.93 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  37.82 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  38.36 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  36.21 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  34.05 
 
 		 232 aa  148  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  35.78 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  35.98 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  35.9 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  35.9 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  35.9 
 
 		 244 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  35 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  41.56 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  34.93 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  40.26 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  41.03 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  34.78 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  35.53 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  33.5 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  34.5 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  27.98 
 
 		 252 aa  92.8  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  36.87 
 
 		 239 aa  92.8  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  36.73 
 
 		 243 aa  92  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  32.69 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  28.46 
 
 		 246 aa  85.5  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  32.67 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  32.67 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  33.17 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  35.48 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  28.88 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  33.76 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  31.9 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  35.04 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  29.73 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  35.03 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  35.21 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  28.57 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  32.7 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  24.76 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  27.16 
 
 		 237 aa  72  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  34.81 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  32.24 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  28.65 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  31.1 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  29.22 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  34.03 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  32.98 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  35.11 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  28.88 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  28.81 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  30.9 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  34.01 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  34.03 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  28.5 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3255  glutamine amidotransferase class-I  32.65 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  35.22 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  32.35 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3244  glutamine amidotransferase class-I  32.65 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  31.07 
 
 		 282 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3306  glutamine amidotransferase class-I  32.65 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0142588 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  28.5 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  35.11 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47463  Predicted glutamine synthetase glutamine amidotransferase  28.71 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.881138 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  26.61 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  30.24 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  35.11 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  35.11 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  26.27 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  27.62 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  27.32 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  34.19 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  33.56 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3848  glutamine amidotransferase class-I  36.13 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  32.65 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  29.41 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  31.85 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  29.94 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  32.32 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  30.91 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  31.32 
 
 		 510 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  31.25 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  25.63 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  30.73 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>