53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0615 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0615  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 296 aa  597  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1856  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  77.7 
 
 		 292 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3334  xylose isomerase domain-containing protein  58.25 
 
 		 277 aa  328  9e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4011  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.79 
 
 		 276 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.44 
 
 		 276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2281  hitchhiker  0.0000101278 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04075  conserved hypothetical protein  51.2 
 
 		 280 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0808004  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04037  hypothetical protein  51.2 
 
 		 280 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4771  AP endonuclease  51.2 
 
 		 280 aa  275  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000229139  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3803  xylose isomerase domain-containing protein  50.86 
 
 		 280 aa  275  7e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465718  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4453  AP endonuclease  50.86 
 
 		 280 aa  275  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000121679  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4680  AP endonuclease  50.52 
 
 		 280 aa  271  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.110375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4176  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.63 
 
 		 394 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346853  hitchhiker  0.000695283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.76 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2423  xylose isomerase domain-containing protein  46.53 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0964314  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1719  hypothetical protein  47.7 
 
 		 293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362033  normal  0.0199285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2882  xylose isomerase domain-containing protein  45.76 
 
 		 276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6726  putative endonuclease protein  44.25 
 
 		 285 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0137  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.25 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3367  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.84 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2177  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.3 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000702324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3593  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.66 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244317  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1107  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.32 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2459  xylose isomerase domain-containing protein  45.04 
 
 		 292 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0140499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4583  xylose isomerase domain-containing protein  37.76 
 
 		 278 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29070  sugar phosphate isomerase/epimerase  44.1 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1079  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  43.06 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4007  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.4 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.62 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  0.603305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.11 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06440  sugar phosphate isomerase/epimerase  39.86 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2853  xylose isomerase domain-containing protein  43.62 
 
 		 274 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.37 
 
 		 290 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.834913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.81 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0606369  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2394  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.9 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.515446  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3702  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.58 
 
 		 313 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4228  xylose isomerase domain-containing protein  27.04 
 
 		 268 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4709  myo-inositol catabolism protein  28.37 
 
 		 277 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0492702  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3597  xylose isomerase domain-containing protein  28.35 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.791675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12330  sugar phosphate isomerase/epimerase  30.83 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205248  normal  0.361397 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  25.66 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2495  xylose isomerase domain-containing protein  26.72 
 
 		 261 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4045  xylose isomerase domain-containing protein  23.85 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  27.27 
 
 		 295 aa  45.8  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4578  xylose isomerase domain-containing protein  32.76 
 
 		 137 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.615471  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11110  sugar phosphate isomerase/epimerase  28.8 
 
 		 480 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  24.62 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1876  xylose isomerase domain-containing protein  28.24 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4652  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  28.57 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  28.97 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  24.22 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1896  xylose isomerase-like TIM barrel  28.24 
 
 		 264 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1942  xylose isomerase domain-containing protein  28.24 
 
 		 264 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>