38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6119 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6119  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  778    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6118  hypothetical protein  84.29 
 
 		 393 aa  550  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3129  hypothetical protein  28.87 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03150  hypothetical protein  44.14 
 
 		 690 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  36.79 
 
 		 690 aa  63.2  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  42.06 
 
 		 3474 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  36.7 
 
 		 2377 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  33.96 
 
 		 9867 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  39.25 
 
 		 3477 aa  57.4  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  35.78 
 
 		 4978 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  30.77 
 
 		 3191 aa  56.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  29.78 
 
 		 1597 aa  53.1  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  40.37 
 
 		 2816 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26340  hypothetical protein  44.93 
 
 		 654 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  37.27 
 
 		 2839 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.64 
 
 		 3816 aa  50.8  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  34.51 
 
 		 4848 aa  50.4  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  39.82 
 
 		 1131 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  36.61 
 
 		 814 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.6 
 
 		 761 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.02 
 
 		 850 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1131 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  33.63 
 
 		 721 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.2 
 
 		 2812 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  32.38 
 
 		 4896 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.36 
 
 		 994 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  36.09 
 
 		 1394 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2532  multicopper oxidase, type 2  37.17 
 
 		 1131 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  36.45 
 
 		 1269 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2552  hypothetical protein  35.19 
 
 		 743 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.97 
 
 		 2346 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  38.89 
 
 		 1269 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.03 
 
 		 4122 aa  43.9  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2366  hypothetical protein  35.19 
 
 		 743 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  32.04 
 
 		 1035 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2953  hypothetical protein  35.78 
 
 		 743 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143577  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2802  glycoside hydrolase family 5  31.28 
 
 		 677 aa  43.5  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461879  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.58 
 
 		 4836 aa  43.1  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>