122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2354 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2354  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19546  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3135  hypothetical protein  50.69 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2091  metal-dependent hydrolase  41.53 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3653  metal-dependent hydrolase-like protein  40.8 
 
 		 284 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4691  hypothetical protein  38.96 
 
 		 277 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53530  hypothetical protein  38.96 
 
 		 277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3654  metal-dependent hydrolase-like protein  39.36 
 
 		 281 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4103  FF domain-containing protein  39.08 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.852892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0083  metal-dependent hydrolase-like protein  35.52 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44510  hypothetical protein  34.69 
 
 		 278 aa  148  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.319734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2618  metal-dependent hydrolase-like protein  33.83 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00276728  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3790  hypothetical protein  35.38 
 
 		 278 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1930  metal-dependent hydrolase-like protein  37.02 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242298 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0738  metal-dependent hydrolase  36.22 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0667904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2960  hypothetical protein  34 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4513  metal-dependent hydrolase  38.4 
 
 		 285 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2259  metal-dependent hydrolase-like  36.5 
 
 		 307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0372522  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4526  metal-dependent hydrolase-like  36.5 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3837  metal-dependent hydrolase-like protein  36.5 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0372117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3688  metal-dependent hydrolase-like protein  36.5 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4904  metal-dependent hydrolase-like protein  34.75 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  hitchhiker  0.000304166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3601  FF domain-containing protein  35.36 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0555  hypothetical protein  32.98 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0628824  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0906  hypothetical protein  31.63 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2610  hypothetical protein  31.63 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2472  hypothetical protein  31.63 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0165  hypothetical protein  35.06 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0932  FF domain-containing protein  36.29 
 
 		 294 aa  128  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438166  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2084  FF domain-containing protein  35.1 
 
 		 296 aa  128  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0314  metal-dependent hydrolase  34.78 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4593  metal-dependent hydrolase  34.35 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4629  metal-dependent hydrolase  34.35 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5561  metal-dependent hydrolase-like protein  34.98 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3737  metal-dependent hydrolase-like protein  33.57 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1350  FF domain-containing protein  34.51 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.0894985 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3199  metal-dependent hydrolase  33.98 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3261  metal-dependent hydrolase  33.98 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3208  metal-dependent hydrolase  33.98 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4070  metal-dependent hydrolase  33.83 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.954367  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4017  metal-dependent hydrolase  31.41 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279425  normal  0.558393 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1143  metal-dependent hydrolase  31.34 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316817  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0453  hypothetical protein  31.52 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0464  hypothetical protein  31.52 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.416793  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0440  hypothetical protein  31.52 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0169  hypothetical protein  33.7 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1012  hypothetical protein  33.7 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1341  hypothetical protein  33.7 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2739  hypothetical protein  33.7 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.910549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2596  hypothetical protein  33.7 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0196  hypothetical protein  33.7 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12790  hypothetical protein  34.09 
 
 		 356 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.89049  normal  0.675408 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0463  hypothetical protein  33.58 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1473  hypothetical protein  32.56 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2822  hypothetical protein  33.99 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000149451  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3692  metal-dependent hydrolase  32.42 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4676  metal-dependent hydrolase  32.42 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5624  metal-dependent hydrolase  32.42 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3362  FF domain protein  42.14 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2523  hypothetical protein  32.05 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0560  hypothetical protein  32.05 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1345  hypothetical protein  32.05 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1007  metal-dependent hydrolase  32.05 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1268  hypothetical protein  32.05 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4528  metal-dependent hydrolase  32.94 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5371  hypothetical protein  33.46 
 
 		 311 aa  105  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.971328 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3015  FF domain protein  41.51 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4877  membrane protein  30.36 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000561399  normal  0.621694 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1791  hypothetical protein  30.18 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000624384 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0723  hypothetical protein  34.41 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0738  hypothetical protein  34.41 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1250  metal-dependent hydrolase  33.72 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1703  hypothetical protein  34.41 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2446  hypothetical protein  34.41 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1177  hypothetical protein  34.41 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8730  hypothetical protein  33.8 
 
 		 301 aa  99  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1556  hypothetical protein  32.32 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2251  putative metal-dependent hydrolase  29.18 
 
 		 311 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000117397  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2173  hypothetical protein  33.83 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425702  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1809  FF domain-containing protein  33 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0912  hypothetical protein  33.83 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0391882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0819  hypothetical protein  33.83 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3648  metal-dependent hydrolase  28.89 
 
 		 301 aa  86.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1795  hypothetical protein  31.85 
 
 		 295 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21040  hypothetical protein  30.84 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1296  FF domain protein  34.21 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0684567  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4970  metal-dependent hydrolase  28.85 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0708  metal-dependent hydrolase  32.11 
 
 		 301 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3397  metal-dependent hydrolase  28.68 
 
 		 312 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4392  metal-dependent hydrolase  33.52 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5316  metal-dependent hydrolase  31.58 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.14239 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4911  metal-dependent hydrolase  33.52 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1360  metal-dependent hydrolase  33.16 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4340  hypothetical protein  28.68 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2874  hypothetical protein  26.84 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2918  hypothetical protein  26.84 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3084  hypothetical protein  29.23 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.531586  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2904  hypothetical protein  26.84 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3179  hypothetical protein  27.97 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.17273  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_003296  RS02367  hypothetical protein  32.12 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3425  hypothetical protein  27.69 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>