120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12790 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12790  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  729    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.89049  normal  0.675408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8730  hypothetical protein  50.7 
 
 
301 aa  285  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1296  FF domain protein  42.2 
 
 
298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0684567  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1360  metal-dependent hydrolase  42.2 
 
 
298 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21040  hypothetical protein  42.71 
 
 
295 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1795  hypothetical protein  43.12 
 
 
295 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4911  metal-dependent hydrolase  41.52 
 
 
301 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562642  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4392  metal-dependent hydrolase  40.91 
 
 
301 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4340  hypothetical protein  41.01 
 
 
306 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0478  Uncharacterized conserved protein UCP07580  37.71 
 
 
298 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0453  hypothetical protein  41.03 
 
 
302 aa  222  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0464  hypothetical protein  41.03 
 
 
302 aa  222  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.416793  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0440  hypothetical protein  41.03 
 
 
302 aa  222  9e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3648  metal-dependent hydrolase  41.01 
 
 
301 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3397  metal-dependent hydrolase  38.74 
 
 
312 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1809  FF domain-containing protein  39.08 
 
 
302 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5316  metal-dependent hydrolase  39.86 
 
 
301 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.14239 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4970  metal-dependent hydrolase  39.86 
 
 
301 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0708  metal-dependent hydrolase  40.29 
 
 
301 aa  215  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1193  FF domain-containing protein  37.99 
 
 
440 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0958504  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0912  hypothetical protein  38.73 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0391882  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2173  hypothetical protein  38.73 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425702  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1093  Uncharacterized conserved protein UCP07580  39.86 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0819  hypothetical protein  38.73 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2251  putative metal-dependent hydrolase  41.52 
 
 
311 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000117397  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1638  hypothetical protein  39.71 
 
 
300 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0221  hypothetical protein  39.35 
 
 
434 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1062  hypothetical protein  39.35 
 
 
300 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0052  hypothetical protein  39.35 
 
 
300 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0366  hypothetical protein  39.35 
 
 
300 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1219  hypothetical protein  39.35 
 
 
300 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1727  hypothetical protein  39.35 
 
 
300 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2874  hypothetical protein  37.89 
 
 
299 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2918  hypothetical protein  37.89 
 
 
299 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3179  hypothetical protein  39.24 
 
 
300 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.17273  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2904  hypothetical protein  37.89 
 
 
299 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3425  hypothetical protein  38.83 
 
 
300 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44510  hypothetical protein  30.65 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.319734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2618  metal-dependent hydrolase-like protein  29.46 
 
 
278 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00276728  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3790  hypothetical protein  29.5 
 
 
278 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3653  metal-dependent hydrolase-like protein  30.58 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5371  hypothetical protein  30.27 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.971328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53530  hypothetical protein  31.43 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000569349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4691  hypothetical protein  31.75 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3654  metal-dependent hydrolase-like protein  30.45 
 
 
281 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0165  hypothetical protein  29.68 
 
 
297 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2354  hypothetical protein  33.59 
 
 
278 aa  107  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19546  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4593  metal-dependent hydrolase  29.56 
 
 
289 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0314  metal-dependent hydrolase  34.5 
 
 
289 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3199  metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 
289 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3261  metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 
289 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604698  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3208  metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 
289 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2960  hypothetical protein  31.32 
 
 
291 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2091  metal-dependent hydrolase  34.07 
 
 
272 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1930  metal-dependent hydrolase-like protein  29.76 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.242298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4629  metal-dependent hydrolase  33.5 
 
 
289 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2259  metal-dependent hydrolase-like  30.68 
 
 
307 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0372522  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1556  hypothetical protein  31.48 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4526  metal-dependent hydrolase-like  30.5 
 
 
305 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3837  metal-dependent hydrolase-like protein  30.5 
 
 
305 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0372117  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3688  metal-dependent hydrolase-like protein  30.5 
 
 
305 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4513  metal-dependent hydrolase  29.9 
 
 
285 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0723  hypothetical protein  30.4 
 
 
306 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2446  hypothetical protein  30.74 
 
 
294 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0738  hypothetical protein  30.4 
 
 
306 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1250  metal-dependent hydrolase  30.4 
 
 
306 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1177  hypothetical protein  30.4 
 
 
306 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1703  hypothetical protein  30.74 
 
 
294 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4017  metal-dependent hydrolase  29.39 
 
 
301 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279425  normal  0.558393 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4904  metal-dependent hydrolase-like protein  32.05 
 
 
303 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  hitchhiker  0.000304166 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3692  metal-dependent hydrolase  30.54 
 
 
301 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4528  metal-dependent hydrolase  29.59 
 
 
301 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5561  metal-dependent hydrolase-like protein  31.62 
 
 
307 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4676  metal-dependent hydrolase  30.54 
 
 
301 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5624  metal-dependent hydrolase  30.45 
 
 
301 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1143  metal-dependent hydrolase  29.63 
 
 
301 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316817  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1473  hypothetical protein  29.39 
 
 
304 aa  90.9  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3737  metal-dependent hydrolase-like protein  31.14 
 
 
307 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4103  FF domain-containing protein  30.04 
 
 
285 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.852892  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2523  hypothetical protein  29.77 
 
 
304 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0560  hypothetical protein  29.77 
 
 
304 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1345  hypothetical protein  29.77 
 
 
304 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1268  hypothetical protein  29.77 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1007  metal-dependent hydrolase  29.77 
 
 
304 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4877  membrane protein  29.35 
 
 
293 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000561399  normal  0.621694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0083  metal-dependent hydrolase-like protein  28.88 
 
 
282 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4070  metal-dependent hydrolase  29.55 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.954367  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1350  FF domain-containing protein  27.67 
 
 
287 aa  86.7  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.0894985 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0555  hypothetical protein  28.89 
 
 
302 aa  86.3  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0628824  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0169  hypothetical protein  29.96 
 
 
296 aa  85.9  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1341  hypothetical protein  29.96 
 
 
296 aa  85.9  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2739  hypothetical protein  29.96 
 
 
296 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.910549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2596  hypothetical protein  29.96 
 
 
296 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0196  hypothetical protein  29.96 
 
 
296 aa  85.9  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1012  hypothetical protein  29.96 
 
 
284 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3362  FF domain protein  33.33 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270556  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2822  hypothetical protein  28.03 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000149451  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3015  FF domain protein  32.69 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1791  hypothetical protein  28.32 
 
 
293 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000624384 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0906  hypothetical protein  28.15 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>