121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0083 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0083  metal-dependent hydrolase-like protein  100 
 
 
282 aa  582  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3653  metal-dependent hydrolase-like protein  48.35 
 
 
284 aa  254  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4691  hypothetical protein  47.58 
 
 
277 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53530  hypothetical protein  47.58 
 
 
277 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000569349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3654  metal-dependent hydrolase-like protein  45.59 
 
 
281 aa  249  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2091  metal-dependent hydrolase  45.39 
 
 
272 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2960  hypothetical protein  40.24 
 
 
291 aa  198  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1930  metal-dependent hydrolase-like protein  39.78 
 
 
293 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.242298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0165  hypothetical protein  39.69 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0906  hypothetical protein  39.57 
 
 
302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2610  hypothetical protein  39.57 
 
 
302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2472  hypothetical protein  39.57 
 
 
302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3737  metal-dependent hydrolase-like protein  41.82 
 
 
307 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4103  FF domain-containing protein  38.89 
 
 
285 aa  181  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.852892  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0555  hypothetical protein  39.21 
 
 
302 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0628824  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4513  metal-dependent hydrolase  40.08 
 
 
285 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4904  metal-dependent hydrolase-like protein  40.98 
 
 
303 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  hitchhiker  0.000304166 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1791  hypothetical protein  39.16 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000624384 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2084  FF domain-containing protein  36.46 
 
 
296 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4877  membrane protein  38.78 
 
 
293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000561399  normal  0.621694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2259  metal-dependent hydrolase-like  38.91 
 
 
307 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0372522  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3790  hypothetical protein  37.05 
 
 
278 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4526  metal-dependent hydrolase-like  38.91 
 
 
305 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5561  metal-dependent hydrolase-like protein  41.09 
 
 
307 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3837  metal-dependent hydrolase-like protein  38.91 
 
 
305 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0372117  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3688  metal-dependent hydrolase-like protein  38.91 
 
 
305 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4070  metal-dependent hydrolase  37.27 
 
 
301 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.954367  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3135  hypothetical protein  39.3 
 
 
300 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4017  metal-dependent hydrolase  37.64 
 
 
301 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279425  normal  0.558393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44510  hypothetical protein  35.97 
 
 
278 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.319734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2618  metal-dependent hydrolase-like protein  37.3 
 
 
278 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00276728  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1473  hypothetical protein  38.11 
 
 
304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4528  metal-dependent hydrolase  35.06 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1143  metal-dependent hydrolase  37.36 
 
 
301 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316817  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5624  metal-dependent hydrolase  34.69 
 
 
301 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3692  metal-dependent hydrolase  35.06 
 
 
301 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4676  metal-dependent hydrolase  35.06 
 
 
301 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0738  metal-dependent hydrolase  39.68 
 
 
297 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0667904 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2523  hypothetical protein  36.05 
 
 
304 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3601  FF domain-containing protein  37.16 
 
 
290 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0560  hypothetical protein  36.05 
 
 
304 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1345  hypothetical protein  36.05 
 
 
304 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1007  metal-dependent hydrolase  36.05 
 
 
304 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1350  FF domain-containing protein  36.1 
 
 
287 aa  156  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.0894985 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1268  hypothetical protein  35.66 
 
 
298 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2446  hypothetical protein  37.31 
 
 
294 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1556  hypothetical protein  36.96 
 
 
294 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1703  hypothetical protein  37.31 
 
 
294 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3362  FF domain protein  35.63 
 
 
298 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270556  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0723  hypothetical protein  37.31 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0738  hypothetical protein  37.31 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3015  FF domain protein  37.74 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1177  hypothetical protein  37.31 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2822  hypothetical protein  38.64 
 
 
267 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000149451  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1250  metal-dependent hydrolase  36.92 
 
 
306 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0169  hypothetical protein  35 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0932  FF domain-containing protein  32.75 
 
 
294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438166  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1341  hypothetical protein  35 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2739  hypothetical protein  35 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.910549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2596  hypothetical protein  35 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0196  hypothetical protein  35 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1012  hypothetical protein  35.51 
 
 
284 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0463  hypothetical protein  33.98 
 
 
301 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2354  hypothetical protein  36.19 
 
 
278 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19546  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4629  metal-dependent hydrolase  33.94 
 
 
289 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4593  metal-dependent hydrolase  32.06 
 
 
289 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0314  metal-dependent hydrolase  32.74 
 
 
289 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3199  metal-dependent hydrolase  38.58 
 
 
289 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3261  metal-dependent hydrolase  38.58 
 
 
289 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604698  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3208  metal-dependent hydrolase  38.58 
 
 
289 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5371  hypothetical protein  32.55 
 
 
311 aa  109  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.971328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2251  putative metal-dependent hydrolase  29.82 
 
 
311 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000117397  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0453  hypothetical protein  32.08 
 
 
302 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0464  hypothetical protein  32.08 
 
 
302 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.416793  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0440  hypothetical protein  32.08 
 
 
302 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3084  hypothetical protein  34.04 
 
 
296 aa  94.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.531586  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_003296  RS02367  hypothetical protein  31.98 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.117709 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4392  metal-dependent hydrolase  27.74 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8730  hypothetical protein  31.37 
 
 
301 aa  89  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12790  hypothetical protein  28.88 
 
 
356 aa  89  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.89049  normal  0.675408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4340  hypothetical protein  25.56 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4911  metal-dependent hydrolase  27.64 
 
 
301 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562642  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0708  metal-dependent hydrolase  26.47 
 
 
301 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3397  metal-dependent hydrolase  26.91 
 
 
312 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4970  metal-dependent hydrolase  27.21 
 
 
301 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5316  metal-dependent hydrolase  27.21 
 
 
301 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.14239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3648  metal-dependent hydrolase  29.96 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1296  FF domain protein  27.95 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0684567  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1062  hypothetical protein  34.33 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0052  hypothetical protein  34.33 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0366  hypothetical protein  34.33 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1219  hypothetical protein  34.33 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3425  hypothetical protein  29.57 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1809  FF domain-containing protein  27.27 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1360  metal-dependent hydrolase  30.14 
 
 
298 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0221  hypothetical protein  34.33 
 
 
434 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1193  FF domain-containing protein  33.67 
 
 
440 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0958504  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1638  hypothetical protein  33.67 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1093  Uncharacterized conserved protein UCP07580  28.57 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2173  hypothetical protein  28.51 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>