122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3425 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3425  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3179  hypothetical protein  86 
 
 
300 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.17273  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2874  hypothetical protein  78.33 
 
 
299 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2918  hypothetical protein  78.33 
 
 
299 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2904  hypothetical protein  78.33 
 
 
299 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4340  hypothetical protein  57.49 
 
 
306 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0478  Uncharacterized conserved protein UCP07580  50.5 
 
 
298 aa  298  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1093  Uncharacterized conserved protein UCP07580  46.58 
 
 
293 aa  254  8e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21040  hypothetical protein  42.47 
 
 
295 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4392  metal-dependent hydrolase  40.56 
 
 
301 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4911  metal-dependent hydrolase  40.35 
 
 
301 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562642  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3397  metal-dependent hydrolase  39.86 
 
 
312 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1360  metal-dependent hydrolase  41.2 
 
 
298 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4970  metal-dependent hydrolase  39.86 
 
 
301 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5316  metal-dependent hydrolase  39.86 
 
 
301 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.14239 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12790  hypothetical protein  40.28 
 
 
356 aa  205  8e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.89049  normal  0.675408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1795  hypothetical protein  41.99 
 
 
295 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8730  hypothetical protein  41.2 
 
 
301 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0708  metal-dependent hydrolase  39.16 
 
 
301 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1193  FF domain-containing protein  40.79 
 
 
440 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0958504  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1296  FF domain protein  41.2 
 
 
298 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0684567  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1809  FF domain-containing protein  40.69 
 
 
302 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3648  metal-dependent hydrolase  39.64 
 
 
301 aa  201  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0221  hypothetical protein  41.22 
 
 
434 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2173  hypothetical protein  39.66 
 
 
302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0912  hypothetical protein  39.66 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0391882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1727  hypothetical protein  41.22 
 
 
300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0819  hypothetical protein  39.66 
 
 
302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1062  hypothetical protein  41.22 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0052  hypothetical protein  41.22 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0366  hypothetical protein  41.22 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1219  hypothetical protein  41.22 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1638  hypothetical protein  41.22 
 
 
300 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2251  putative metal-dependent hydrolase  36.71 
 
 
311 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000117397  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0453  hypothetical protein  38.43 
 
 
302 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0464  hypothetical protein  38.43 
 
 
302 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.416793  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0440  hypothetical protein  38.43 
 
 
302 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53530  hypothetical protein  34.58 
 
 
277 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000569349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4691  hypothetical protein  35.05 
 
 
277 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3653  metal-dependent hydrolase-like protein  32.56 
 
 
284 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2618  metal-dependent hydrolase-like protein  28.52 
 
 
278 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00276728  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3790  hypothetical protein  29.1 
 
 
278 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44510  hypothetical protein  28.32 
 
 
278 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.319734 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5371  hypothetical protein  27.86 
 
 
311 aa  102  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.971328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3654  metal-dependent hydrolase-like protein  32.87 
 
 
281 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0165  hypothetical protein  28.21 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3199  metal-dependent hydrolase  30.28 
 
 
289 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3261  metal-dependent hydrolase  30.28 
 
 
289 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604698  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3208  metal-dependent hydrolase  30.28 
 
 
289 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4593  metal-dependent hydrolase  29.96 
 
 
289 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0314  metal-dependent hydrolase  28.93 
 
 
289 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2960  hypothetical protein  30.88 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1930  metal-dependent hydrolase-like protein  28.2 
 
 
293 aa  86.3  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.242298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4629  metal-dependent hydrolase  28.52 
 
 
289 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2091  metal-dependent hydrolase  31.52 
 
 
272 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4513  metal-dependent hydrolase  27.34 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1556  hypothetical protein  29.51 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0738  metal-dependent hydrolase  27.9 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0667904 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3601  FF domain-containing protein  28.17 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3362  FF domain protein  33.97 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270556  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0083  metal-dependent hydrolase-like protein  29.57 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2822  hypothetical protein  29.03 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000149451  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0723  hypothetical protein  26.94 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2446  hypothetical protein  27.31 
 
 
294 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1350  FF domain-containing protein  32.09 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.0894985 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0738  hypothetical protein  26.94 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1250  metal-dependent hydrolase  27.57 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1177  hypothetical protein  27.57 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1703  hypothetical protein  26.94 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3015  FF domain protein  32.73 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1473  hypothetical protein  28.29 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1268  hypothetical protein  27.59 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2523  hypothetical protein  27.59 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0555  hypothetical protein  26.88 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0628824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0560  hypothetical protein  27.59 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1345  hypothetical protein  27.59 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1007  metal-dependent hydrolase  27.59 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1143  metal-dependent hydrolase  26.48 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316817  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0932  FF domain-containing protein  28.57 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438166  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1791  hypothetical protein  27.46 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000624384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4070  metal-dependent hydrolase  26.48 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.954367  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3692  metal-dependent hydrolase  25.7 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4676  metal-dependent hydrolase  25.7 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5624  metal-dependent hydrolase  25.7 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4103  FF domain-containing protein  27.17 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.852892  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0169  hypothetical protein  27.49 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0906  hypothetical protein  26.52 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1012  hypothetical protein  27.49 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2084  FF domain-containing protein  26.57 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1341  hypothetical protein  27.49 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2610  hypothetical protein  26.52 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2739  hypothetical protein  27.49 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.910549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2472  hypothetical protein  26.52 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2596  hypothetical protein  27.49 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0196  hypothetical protein  27.49 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4877  membrane protein  27.46 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000561399  normal  0.621694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4528  metal-dependent hydrolase  26.48 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3135  hypothetical protein  29.21 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4017  metal-dependent hydrolase  26.48 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279425  normal  0.558393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2354  hypothetical protein  30.12 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>