117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3692 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3692  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
301 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4676  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
301 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5624  metal-dependent hydrolase  99.67 
 
 
301 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1143  metal-dependent hydrolase  95.68 
 
 
301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316817  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4528  metal-dependent hydrolase  96.01 
 
 
301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4017  metal-dependent hydrolase  93.02 
 
 
301 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279425  normal  0.558393 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4070  metal-dependent hydrolase  91.03 
 
 
301 aa  577  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.954367  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1473  hypothetical protein  86.53 
 
 
304 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2523  hypothetical protein  85 
 
 
304 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0560  hypothetical protein  85 
 
 
304 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1345  hypothetical protein  85 
 
 
304 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1007  metal-dependent hydrolase  85 
 
 
304 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1268  hypothetical protein  85.03 
 
 
298 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0169  hypothetical protein  73.13 
 
 
296 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1341  hypothetical protein  73.13 
 
 
296 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2739  hypothetical protein  73.13 
 
 
296 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.910549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2596  hypothetical protein  73.13 
 
 
296 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0196  hypothetical protein  73.13 
 
 
296 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0463  hypothetical protein  71.29 
 
 
301 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1012  hypothetical protein  72.03 
 
 
284 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1791  hypothetical protein  73.65 
 
 
293 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000624384 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4877  membrane protein  71.53 
 
 
293 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000561399  normal  0.621694 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0906  hypothetical protein  63.83 
 
 
302 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2610  hypothetical protein  63.83 
 
 
302 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2472  hypothetical protein  63.83 
 
 
302 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0555  hypothetical protein  63.35 
 
 
302 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0628824  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1556  hypothetical protein  61.11 
 
 
294 aa  371  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3737  metal-dependent hydrolase-like protein  63.19 
 
 
307 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2259  metal-dependent hydrolase-like  65.8 
 
 
307 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0372522  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4526  metal-dependent hydrolase-like  66.17 
 
 
305 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3837  metal-dependent hydrolase-like protein  66.17 
 
 
305 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0372117  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3688  metal-dependent hydrolase-like protein  66.17 
 
 
305 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2446  hypothetical protein  60 
 
 
294 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1250  metal-dependent hydrolase  59.66 
 
 
306 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1177  hypothetical protein  60 
 
 
306 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1703  hypothetical protein  59.66 
 
 
294 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0723  hypothetical protein  59.66 
 
 
306 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0738  hypothetical protein  59.66 
 
 
306 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5561  metal-dependent hydrolase-like protein  62.85 
 
 
307 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4904  metal-dependent hydrolase-like protein  64.07 
 
 
303 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  hitchhiker  0.000304166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3601  FF domain-containing protein  58.16 
 
 
290 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3015  FF domain protein  54.17 
 
 
298 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3362  FF domain protein  53.12 
 
 
298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270556  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2618  metal-dependent hydrolase-like protein  43.13 
 
 
278 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00276728  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3790  hypothetical protein  43.89 
 
 
278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1930  metal-dependent hydrolase-like protein  44.88 
 
 
293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.242298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44510  hypothetical protein  43.89 
 
 
278 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.319734 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0165  hypothetical protein  40.86 
 
 
297 aa  191  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53530  hypothetical protein  40.88 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000569349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4691  hypothetical protein  40.88 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3653  metal-dependent hydrolase-like protein  39.78 
 
 
284 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2091  metal-dependent hydrolase  40.81 
 
 
272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3654  metal-dependent hydrolase-like protein  40.29 
 
 
281 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4103  FF domain-containing protein  39.43 
 
 
285 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.852892  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4513  metal-dependent hydrolase  38.4 
 
 
285 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0083  metal-dependent hydrolase-like protein  35.06 
 
 
282 aa  159  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2960  hypothetical protein  35.71 
 
 
291 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0314  metal-dependent hydrolase  37.27 
 
 
289 aa  155  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4593  metal-dependent hydrolase  35.45 
 
 
289 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4629  metal-dependent hydrolase  36 
 
 
289 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3199  metal-dependent hydrolase  34.44 
 
 
289 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3261  metal-dependent hydrolase  34.44 
 
 
289 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604698  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3208  metal-dependent hydrolase  34.44 
 
 
289 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0932  FF domain-containing protein  36.7 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438166  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2822  hypothetical protein  38.01 
 
 
267 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000149451  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0738  metal-dependent hydrolase  35.77 
 
 
297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0667904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1350  FF domain-containing protein  34.05 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.0894985 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2084  FF domain-containing protein  32.96 
 
 
296 aa  134  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5371  hypothetical protein  34.54 
 
 
311 aa  119  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.971328 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2354  hypothetical protein  31.66 
 
 
278 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19546  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3135  hypothetical protein  31.94 
 
 
300 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8730  hypothetical protein  30.58 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12790  hypothetical protein  30.54 
 
 
356 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.89049  normal  0.675408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0453  hypothetical protein  34.31 
 
 
302 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0464  hypothetical protein  34.31 
 
 
302 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.416793  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0440  hypothetical protein  34.31 
 
 
302 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2251  putative metal-dependent hydrolase  27.44 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000117397  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3084  hypothetical protein  25.96 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.531586  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1360  metal-dependent hydrolase  28.67 
 
 
298 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1296  FF domain protein  29.82 
 
 
298 aa  85.5  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0684567  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4340  hypothetical protein  31.3 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21040  hypothetical protein  28.34 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1093  Uncharacterized conserved protein UCP07580  31.15 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1795  hypothetical protein  27.66 
 
 
295 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4392  metal-dependent hydrolase  28.16 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4911  metal-dependent hydrolase  28.16 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562642  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3648  metal-dependent hydrolase  27.56 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2874  hypothetical protein  28.4 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2918  hypothetical protein  28.4 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2904  hypothetical protein  28.4 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3397  metal-dependent hydrolase  26.8 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4970  metal-dependent hydrolase  26.8 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5316  metal-dependent hydrolase  27.09 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.14239 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3425  hypothetical protein  26.48 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02367  hypothetical protein  29.26 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.117709 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0708  metal-dependent hydrolase  25.51 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1193  FF domain-containing protein  28.03 
 
 
440 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0958504  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3179  hypothetical protein  27.27 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.17273  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0052  hypothetical protein  27.6 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0366  hypothetical protein  27.6 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>