121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_21040 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_21040  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  607  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1795  hypothetical protein  90.11 
 
 
295 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4392  metal-dependent hydrolase  49.82 
 
 
301 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4911  metal-dependent hydrolase  49.47 
 
 
301 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562642  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0708  metal-dependent hydrolase  49.47 
 
 
301 aa  298  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1809  FF domain-containing protein  47.78 
 
 
302 aa  298  9e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3397  metal-dependent hydrolase  49.47 
 
 
312 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4970  metal-dependent hydrolase  49.47 
 
 
301 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5316  metal-dependent hydrolase  49.47 
 
 
301 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.14239 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2173  hypothetical protein  47.44 
 
 
302 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425702  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0819  hypothetical protein  47.44 
 
 
302 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0912  hypothetical protein  47.1 
 
 
302 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0391882  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1296  FF domain protein  50 
 
 
298 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0684567  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3648  metal-dependent hydrolase  48.76 
 
 
301 aa  292  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1360  metal-dependent hydrolase  49.65 
 
 
298 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1727  hypothetical protein  48.06 
 
 
300 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0221  hypothetical protein  48.59 
 
 
434 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1062  hypothetical protein  47.7 
 
 
300 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1193  FF domain-containing protein  47.35 
 
 
440 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0958504  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0052  hypothetical protein  47.7 
 
 
300 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0366  hypothetical protein  47.7 
 
 
300 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1219  hypothetical protein  47.7 
 
 
300 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1638  hypothetical protein  47.7 
 
 
300 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8730  hypothetical protein  43.25 
 
 
301 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12790  hypothetical protein  42.71 
 
 
356 aa  236  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.89049  normal  0.675408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1093  Uncharacterized conserved protein UCP07580  41.72 
 
 
293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0453  hypothetical protein  43.01 
 
 
302 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0464  hypothetical protein  43.01 
 
 
302 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.416793  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0440  hypothetical protein  43.01 
 
 
302 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0478  Uncharacterized conserved protein UCP07580  40.21 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2251  putative metal-dependent hydrolase  39.62 
 
 
311 aa  211  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000117397  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4340  hypothetical protein  40.14 
 
 
306 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3179  hypothetical protein  39.31 
 
 
300 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.17273  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2874  hypothetical protein  38.44 
 
 
299 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2918  hypothetical protein  38.44 
 
 
299 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2904  hypothetical protein  38.44 
 
 
299 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3425  hypothetical protein  41.34 
 
 
300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2618  metal-dependent hydrolase-like protein  29 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00276728  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3790  hypothetical protein  28.46 
 
 
278 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44510  hypothetical protein  29.37 
 
 
278 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.319734 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5371  hypothetical protein  28.67 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.971328 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0165  hypothetical protein  28.52 
 
 
297 aa  93.6  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4691  hypothetical protein  29.81 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3653  metal-dependent hydrolase-like protein  30.51 
 
 
284 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53530  hypothetical protein  29.81 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000569349 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1473  hypothetical protein  28.8 
 
 
304 aa  85.9  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0314  metal-dependent hydrolase  31.94 
 
 
289 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2091  metal-dependent hydrolase  29.58 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3654  metal-dependent hydrolase-like protein  26.77 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4593  metal-dependent hydrolase  29.86 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4017  metal-dependent hydrolase  28.9 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279425  normal  0.558393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2960  hypothetical protein  28.62 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2523  hypothetical protein  28.48 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4070  metal-dependent hydrolase  29.04 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.954367  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0560  hypothetical protein  28.48 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1345  hypothetical protein  28.48 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1007  metal-dependent hydrolase  28.48 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4513  metal-dependent hydrolase  29.2 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4528  metal-dependent hydrolase  27.24 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1930  metal-dependent hydrolase-like protein  28.46 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.242298 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3692  metal-dependent hydrolase  28.34 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5624  metal-dependent hydrolase  28.34 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4676  metal-dependent hydrolase  28.34 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4629  metal-dependent hydrolase  30.56 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1143  metal-dependent hydrolase  27.24 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316817  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1268  hypothetical protein  28.94 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2822  hypothetical protein  28.04 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000149451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2354  hypothetical protein  31.88 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19546  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0303  hypothetical protein  29.77 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3199  metal-dependent hydrolase  27.27 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3261  metal-dependent hydrolase  27.27 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604698  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3208  metal-dependent hydrolase  27.27 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4877  membrane protein  28.01 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000561399  normal  0.621694 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1350  FF domain-containing protein  27.72 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.0894985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3135  hypothetical protein  31.19 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0169  hypothetical protein  26.95 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0738  metal-dependent hydrolase  29.82 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0667904 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1341  hypothetical protein  26.95 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2739  hypothetical protein  26.95 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.910549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2596  hypothetical protein  26.95 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0196  hypothetical protein  26.95 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1791  hypothetical protein  26.95 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000624384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0083  metal-dependent hydrolase-like protein  26.77 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2084  FF domain-containing protein  26.94 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1012  hypothetical protein  26.98 
 
 
284 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0463  hypothetical protein  26.64 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3362  FF domain protein  28.32 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270556  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4095  hypothetical protein  28.88 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440688  normal  0.496826 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0932  FF domain-containing protein  25.82 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438166  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4526  metal-dependent hydrolase-like  29.22 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3837  metal-dependent hydrolase-like protein  29.22 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0372117  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3015  FF domain protein  28.93 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3688  metal-dependent hydrolase-like protein  29.22 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2259  metal-dependent hydrolase-like  29.22 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0372522  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3737  metal-dependent hydrolase-like protein  28.73 
 
 
307 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3084  hypothetical protein  25.12 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.531586  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0555  hypothetical protein  25.18 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0628824  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5561  metal-dependent hydrolase-like protein  27.86 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0906  hypothetical protein  25.18 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4904  metal-dependent hydrolase-like protein  29.09 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  hitchhiker  0.000304166 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>