121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0932 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0932  FF domain-containing protein  100 
 
 
294 aa  597  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438166  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2084  FF domain-containing protein  61.87 
 
 
296 aa  352  4e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1350  FF domain-containing protein  50.19 
 
 
287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.0894985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4103  FF domain-containing protein  47.23 
 
 
285 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.852892  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1930  metal-dependent hydrolase-like protein  39.18 
 
 
293 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.242298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2091  metal-dependent hydrolase  37.45 
 
 
272 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3654  metal-dependent hydrolase-like protein  38.43 
 
 
281 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3653  metal-dependent hydrolase-like protein  36.4 
 
 
284 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0165  hypothetical protein  32.88 
 
 
297 aa  161  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53530  hypothetical protein  35.77 
 
 
277 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000569349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4691  hypothetical protein  36.5 
 
 
277 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2960  hypothetical protein  36.43 
 
 
291 aa  159  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1473  hypothetical protein  38.58 
 
 
304 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1791  hypothetical protein  36.43 
 
 
293 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000624384 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4877  membrane protein  35.84 
 
 
293 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000561399  normal  0.621694 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4070  metal-dependent hydrolase  37.45 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.954367  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1177  hypothetical protein  37.45 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0723  hypothetical protein  37.45 
 
 
306 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2523  hypothetical protein  38.2 
 
 
304 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1143  metal-dependent hydrolase  36.59 
 
 
301 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316817  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1556  hypothetical protein  36.94 
 
 
294 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0560  hypothetical protein  38.2 
 
 
304 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259074  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0738  hypothetical protein  37.45 
 
 
306 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1345  hypothetical protein  38.2 
 
 
304 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1007  metal-dependent hydrolase  38.2 
 
 
304 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2446  hypothetical protein  37.17 
 
 
294 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1703  hypothetical protein  37.17 
 
 
294 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4017  metal-dependent hydrolase  37.05 
 
 
301 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279425  normal  0.558393 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1250  metal-dependent hydrolase  37.09 
 
 
306 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1268  hypothetical protein  37.83 
 
 
298 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3601  FF domain-containing protein  37.76 
 
 
290 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5624  metal-dependent hydrolase  35.87 
 
 
301 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3692  metal-dependent hydrolase  36.7 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4676  metal-dependent hydrolase  36.7 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4528  metal-dependent hydrolase  35.87 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0083  metal-dependent hydrolase-like protein  32.75 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3737  metal-dependent hydrolase-like protein  34.29 
 
 
307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44510  hypothetical protein  34.67 
 
 
278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.319734 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0738  metal-dependent hydrolase  36.82 
 
 
297 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0667904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2822  hypothetical protein  34.75 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000149451  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4526  metal-dependent hydrolase-like  34.04 
 
 
305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3837  metal-dependent hydrolase-like protein  34.04 
 
 
305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0372117  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3688  metal-dependent hydrolase-like protein  34.04 
 
 
305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0169  hypothetical protein  36.63 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2259  metal-dependent hydrolase-like  34.04 
 
 
307 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0372522  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1341  hypothetical protein  36.63 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2739  hypothetical protein  36.63 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.910549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2596  hypothetical protein  36.63 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0196  hypothetical protein  36.63 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5561  metal-dependent hydrolase-like protein  33.57 
 
 
307 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0463  hypothetical protein  36.76 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2618  metal-dependent hydrolase-like protein  33.33 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00276728  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3790  hypothetical protein  34.65 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1012  hypothetical protein  36.54 
 
 
284 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4513  metal-dependent hydrolase  34.9 
 
 
285 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0555  hypothetical protein  32.08 
 
 
302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0628824  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4904  metal-dependent hydrolase-like protein  33.46 
 
 
303 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  hitchhiker  0.000304166 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0906  hypothetical protein  31.14 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2610  hypothetical protein  31.14 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2472  hypothetical protein  31.14 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3015  FF domain protein  36.51 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3362  FF domain protein  36.32 
 
 
298 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270556  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2354  hypothetical protein  34.59 
 
 
278 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19546  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3199  metal-dependent hydrolase  29.67 
 
 
289 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3261  metal-dependent hydrolase  29.67 
 
 
289 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604698  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3208  metal-dependent hydrolase  29.67 
 
 
289 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3135  hypothetical protein  34.57 
 
 
300 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4593  metal-dependent hydrolase  29.41 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0314  metal-dependent hydrolase  33.7 
 
 
289 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4629  metal-dependent hydrolase  28.37 
 
 
289 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5371  hypothetical protein  31.33 
 
 
311 aa  92.4  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.971328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0453  hypothetical protein  30.8 
 
 
302 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0464  hypothetical protein  30.8 
 
 
302 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.416793  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0440  hypothetical protein  30.8 
 
 
302 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2251  putative metal-dependent hydrolase  28.79 
 
 
311 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000117397  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12790  hypothetical protein  28.36 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.89049  normal  0.675408 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3084  hypothetical protein  30.05 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.531586  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_003296  RS02367  hypothetical protein  30.54 
 
 
250 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.117709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3425  hypothetical protein  28.57 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3648  metal-dependent hydrolase  26.54 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8730  hypothetical protein  30.51 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3179  hypothetical protein  26.47 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.17273  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1296  FF domain protein  30.16 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0684567  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1093  Uncharacterized conserved protein UCP07580  28.57 
 
 
293 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1809  FF domain-containing protein  25.69 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4340  hypothetical protein  24.44 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1360  metal-dependent hydrolase  29.63 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4392  metal-dependent hydrolase  25.3 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1757  hypothetical protein  24.83 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0430  hypothetical protein  24.83 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4911  metal-dependent hydrolase  24.23 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562642  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3397  metal-dependent hydrolase  25.36 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2173  hypothetical protein  26.14 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21040  hypothetical protein  25.82 
 
 
295 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0819  hypothetical protein  26.14 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2874  hypothetical protein  28.35 
 
 
299 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2918  hypothetical protein  28.35 
 
 
299 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2904  hypothetical protein  28.35 
 
 
299 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0912  hypothetical protein  25.76 
 
 
302 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0391882  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4970  metal-dependent hydrolase  25 
 
 
301 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.189788 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>