122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3654 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3654  metal-dependent hydrolase-like protein  100 
 
 		 281 aa  578  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53530  hypothetical protein  72 
 
 		 277 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4691  hypothetical protein  71.68 
 
 		 277 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3653  metal-dependent hydrolase-like protein  70.85 
 
 		 284 aa  407  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2091  metal-dependent hydrolase  47.78 
 
 		 272 aa  269  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0083  metal-dependent hydrolase-like protein  45.59 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2960  hypothetical protein  42.91 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0165  hypothetical protein  42.39 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1930  metal-dependent hydrolase-like protein  42.11 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242298 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2618  metal-dependent hydrolase-like protein  41.11 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00276728  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44510  hypothetical protein  40.3 
 
 		 278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.319734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4103  FF domain-containing protein  39.62 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.852892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3790  hypothetical protein  41.43 
 
 		 278 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4526  metal-dependent hydrolase-like  38.91 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3837  metal-dependent hydrolase-like protein  38.91 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0372117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3688  metal-dependent hydrolase-like protein  38.91 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2259  metal-dependent hydrolase-like  39.25 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0372522  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0555  hypothetical protein  40.3 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0628824  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0906  hypothetical protein  40.3 
 
 		 302 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2610  hypothetical protein  40.3 
 
 		 302 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2472  hypothetical protein  40.3 
 
 		 302 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4877  membrane protein  41.41 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000561399  normal  0.621694 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1791  hypothetical protein  40.77 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000624384 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4017  metal-dependent hydrolase  41.2 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279425  normal  0.558393 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4528  metal-dependent hydrolase  40.48 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1473  hypothetical protein  39.04 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2523  hypothetical protein  41.33 
 
 		 304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0560  hypothetical protein  41.33 
 
 		 304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1345  hypothetical protein  41.33 
 
 		 304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1007  metal-dependent hydrolase  41.33 
 
 		 304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0738  metal-dependent hydrolase  40.24 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0667904 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1143  metal-dependent hydrolase  40.66 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316817  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5624  metal-dependent hydrolase  40.5 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3737  metal-dependent hydrolase-like protein  38.83 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4070  metal-dependent hydrolase  40.82 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.954367  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4904  metal-dependent hydrolase-like protein  39.76 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  hitchhiker  0.000304166 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4513  metal-dependent hydrolase  39.37 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3692  metal-dependent hydrolase  40.29 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4676  metal-dependent hydrolase  40.29 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3135  hypothetical protein  40.49 
 
 		 300 aa  178  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1268  hypothetical protein  41 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2822  hypothetical protein  40.68 
 
 		 267 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000149451  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5561  metal-dependent hydrolase-like protein  38.46 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0932  FF domain-containing protein  38.43 
 
 		 294 aa  171  9e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438166  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3601  FF domain-containing protein  38.78 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2084  FF domain-containing protein  36.62 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0169  hypothetical protein  36.52 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1341  hypothetical protein  36.52 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2739  hypothetical protein  36.52 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.910549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2596  hypothetical protein  36.52 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0196  hypothetical protein  36.52 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1012  hypothetical protein  36.94 
 
 		 284 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0463  hypothetical protein  36.52 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1556  hypothetical protein  40.87 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1350  FF domain-containing protein  35.52 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.0894985 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2446  hypothetical protein  40.31 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2354  hypothetical protein  39.36 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19546  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1177  hypothetical protein  40.31 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0723  hypothetical protein  40.7 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0738  hypothetical protein  40.7 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1703  hypothetical protein  40.7 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1250  metal-dependent hydrolase  39.92 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0314  metal-dependent hydrolase  36.46 
 
 		 289 aa  155  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4629  metal-dependent hydrolase  36.92 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4593  metal-dependent hydrolase  36.93 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3199  metal-dependent hydrolase  34.69 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3261  metal-dependent hydrolase  34.69 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3208  metal-dependent hydrolase  34.69 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3362  FF domain protein  32.94 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3015  FF domain protein  34.38 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5371  hypothetical protein  35.2 
 
 		 311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.971328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0453  hypothetical protein  35.05 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0464  hypothetical protein  35.05 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.416793  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0440  hypothetical protein  35.05 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2251  putative metal-dependent hydrolase  33.79 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000117397  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12790  hypothetical protein  30.45 
 
 		 356 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.89049  normal  0.675408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8730  hypothetical protein  31.31 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4392  metal-dependent hydrolase  28.62 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0478  Uncharacterized conserved protein UCP07580  32.46 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3084  hypothetical protein  33.78 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.531586  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4911  metal-dependent hydrolase  29.1 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3179  hypothetical protein  31.62 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.17273  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3425  hypothetical protein  32.87 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02367  hypothetical protein  32.46 
 
 		 250 aa  99.4  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117709 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3648  metal-dependent hydrolase  29.54 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3397  metal-dependent hydrolase  27.78 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1727  hypothetical protein  30.41 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4970  metal-dependent hydrolase  27.24 
 
 		 301 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0708  metal-dependent hydrolase  26.87 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2874  hypothetical protein  30.77 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2918  hypothetical protein  30.77 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4340  hypothetical protein  27.88 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2904  hypothetical protein  30.77 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5316  metal-dependent hydrolase  27.24 
 
 		 301 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.14239 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1809  FF domain-containing protein  29.91 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1638  hypothetical protein  29.95 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1062  hypothetical protein  30.05 
 
 		 300 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0052  hypothetical protein  30.05 
 
 		 300 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0366  hypothetical protein  30.05 
 
 		 300 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1219  hypothetical protein  30.05 
 
 		 300 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>