100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02367 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02367  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117709 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3654  metal-dependent hydrolase-like protein  32.46 
 
 		 281 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2822  hypothetical protein  34.02 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000149451  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0083  metal-dependent hydrolase-like protein  31.98 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3653  metal-dependent hydrolase-like protein  31.9 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0738  metal-dependent hydrolase  32 
 
 		 297 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0667904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2091  metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1930  metal-dependent hydrolase-like protein  31.84 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242298 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4691  hypothetical protein  34.76 
 
 		 277 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53530  hypothetical protein  34.76 
 
 		 277 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569349 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0906  hypothetical protein  31.06 
 
 		 302 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2472  hypothetical protein  31.06 
 
 		 302 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2610  hypothetical protein  31.06 
 
 		 302 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4513  metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0555  hypothetical protein  30.64 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0628824  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3135  hypothetical protein  30.6 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0932  FF domain-containing protein  30.54 
 
 		 294 aa  78.6  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438166  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1473  hypothetical protein  33.14 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4877  membrane protein  31.14 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000561399  normal  0.621694 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1791  hypothetical protein  31.14 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000624384 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44510  hypothetical protein  26.18 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.319734 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2446  hypothetical protein  31.43 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1250  metal-dependent hydrolase  31.43 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1177  hypothetical protein  31.43 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1345  hypothetical protein  30.95 
 
 		 304 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1268  hypothetical protein  30.95 
 
 		 298 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1007  metal-dependent hydrolase  30.95 
 
 		 304 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0560  hypothetical protein  30.95 
 
 		 304 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259074  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2523  hypothetical protein  30.95 
 
 		 304 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3790  hypothetical protein  26.7 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0738  hypothetical protein  31.4 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1703  hypothetical protein  31.4 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0723  hypothetical protein  31.4 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292888  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2354  hypothetical protein  32.12 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19546  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1143  metal-dependent hydrolase  29.26 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316817  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4904  metal-dependent hydrolase-like protein  33.33 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  hitchhiker  0.000304166 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3737  metal-dependent hydrolase-like protein  31.82 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1556  hypothetical protein  29.83 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4070  metal-dependent hydrolase  31.36 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.954367  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1350  FF domain-containing protein  32.74 
 
 		 287 aa  72  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.0894985 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0165  hypothetical protein  27.43 
 
 		 297 aa  72  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4017  metal-dependent hydrolase  31.28 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279425  normal  0.558393 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3688  metal-dependent hydrolase-like protein  30.17 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4676  metal-dependent hydrolase  29.26 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4526  metal-dependent hydrolase-like  30.17 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3837  metal-dependent hydrolase-like protein  30.17 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0372117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3692  metal-dependent hydrolase  29.26 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5624  metal-dependent hydrolase  30.46 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4528  metal-dependent hydrolase  29.26 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2259  metal-dependent hydrolase-like  30.17 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0372522  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1012  hypothetical protein  34.01 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2596  hypothetical protein  34.01 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0169  hypothetical protein  34.01 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2739  hypothetical protein  34.01 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.910549  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0196  hypothetical protein  34.01 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1341  hypothetical protein  34.01 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0463  hypothetical protein  34.01 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5561  metal-dependent hydrolase-like protein  31.25 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5371  hypothetical protein  27.7 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.971328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4103  FF domain-containing protein  28.7 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.852892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2618  metal-dependent hydrolase-like protein  27.88 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00276728  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3601  FF domain-containing protein  26.79 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3362  FF domain protein  30.57 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3084  hypothetical protein  30.72 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.531586  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3015  FF domain protein  29.52 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1733  metal-dependent hydrolase-like protein  31.82 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3425  hypothetical protein  28.02 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2084  FF domain-containing protein  30 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2960  hypothetical protein  25.99 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21040  hypothetical protein  28.81 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4392  metal-dependent hydrolase  25.22 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3497  hypothetical protein  28.91 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270685  normal  0.173703 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3010  hypothetical protein  29.17 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0358  metal-dependent hydrolase-like protein  28.03 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8730  hypothetical protein  27.78 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3179  hypothetical protein  26.57 
 
 		 300 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.17273  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4911  metal-dependent hydrolase  25.73 
 
 		 301 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2251  putative metal-dependent hydrolase  27.06 
 
 		 311 aa  48.5  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000117397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3559  hypothetical protein  29.13 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0540569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1795  hypothetical protein  28.65 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3554  hypothetical protein  29.75 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3627  hypothetical protein  29.75 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0708  metal-dependent hydrolase  24.89 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3397  metal-dependent hydrolase  24.89 
 
 		 312 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4970  metal-dependent hydrolase  26.71 
 
 		 301 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5316  metal-dependent hydrolase  26.71 
 
 		 301 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.14239 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1727  hypothetical protein  27.61 
 
 		 300 aa  45.4  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0464  hypothetical protein  27.22 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.416793  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0453  hypothetical protein  27.22 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113345  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3648  metal-dependent hydrolase  25.3 
 
 		 301 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0440  hypothetical protein  27.22 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1062  hypothetical protein  28.05 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12790  hypothetical protein  27.95 
 
 		 356 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.89049  normal  0.675408 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0221  hypothetical protein  28.05 
 
 		 434 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1638  hypothetical protein  28.05 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0052  hypothetical protein  28.05 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0366  hypothetical protein  28.05 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1219  hypothetical protein  28.05 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1193  FF domain-containing protein  27.44 
 
 		 440 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0958504  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4340  hypothetical protein  28.11 
 
 		 306 aa  42.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>