122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4392 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4392  metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 301 aa  624  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4911  metal-dependent hydrolase  98.67 
 
 		 301 aa  613  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0708  metal-dependent hydrolase  93.69 
 
 		 301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3397  metal-dependent hydrolase  92.69 
 
 		 312 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4970  metal-dependent hydrolase  93.02 
 
 		 301 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5316  metal-dependent hydrolase  92.69 
 
 		 301 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.14239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3648  metal-dependent hydrolase  90.85 
 
 		 301 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1809  FF domain-containing protein  81.06 
 
 		 302 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2173  hypothetical protein  80.4 
 
 		 302 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0912  hypothetical protein  80.07 
 
 		 302 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0391882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0819  hypothetical protein  80.4 
 
 		 302 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1296  FF domain protein  77.4 
 
 		 298 aa  481  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0684567  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1360  metal-dependent hydrolase  76.71 
 
 		 298 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0221  hypothetical protein  72.05 
 
 		 434 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1062  hypothetical protein  72.05 
 
 		 300 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1193  FF domain-containing protein  71.81 
 
 		 440 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0958504  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0052  hypothetical protein  72.05 
 
 		 300 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0366  hypothetical protein  72.05 
 
 		 300 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1727  hypothetical protein  72.05 
 
 		 300 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1638  hypothetical protein  72.39 
 
 		 300 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1219  hypothetical protein  72.05 
 
 		 300 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21040  hypothetical protein  49.83 
 
 		 295 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1795  hypothetical protein  49.28 
 
 		 295 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8730  hypothetical protein  44.17 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12790  hypothetical protein  41.24 
 
 		 356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.89049  normal  0.675408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0478  Uncharacterized conserved protein UCP07580  42.96 
 
 		 298 aa  228  8e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4340  hypothetical protein  42.61 
 
 		 306 aa  225  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2251  putative metal-dependent hydrolase  41.36 
 
 		 311 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000117397  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3179  hypothetical protein  39.86 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.17273  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2874  hypothetical protein  38.78 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2918  hypothetical protein  38.78 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2904  hypothetical protein  38.78 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0453  hypothetical protein  42.12 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0464  hypothetical protein  42.12 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.416793  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0440  hypothetical protein  42.12 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1093  Uncharacterized conserved protein UCP07580  41.26 
 
 		 293 aa  211  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3425  hypothetical protein  40.07 
 
 		 300 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2618  metal-dependent hydrolase-like protein  31.75 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00276728  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44510  hypothetical protein  29.64 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.319734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3790  hypothetical protein  28.78 
 
 		 278 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0165  hypothetical protein  29.78 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4691  hypothetical protein  32.3 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53530  hypothetical protein  29.78 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3654  metal-dependent hydrolase-like protein  28.62 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2091  metal-dependent hydrolase  34.12 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2960  hypothetical protein  29.12 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0314  metal-dependent hydrolase  33 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4593  metal-dependent hydrolase  32.51 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5371  hypothetical protein  32 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.971328 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1930  metal-dependent hydrolase-like protein  31.07 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4629  metal-dependent hydrolase  32.02 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3653  metal-dependent hydrolase-like protein  29 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4513  metal-dependent hydrolase  31.45 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0083  metal-dependent hydrolase-like protein  27.74 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4017  metal-dependent hydrolase  29.39 
 
 		 301 aa  85.5  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279425  normal  0.558393 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4070  metal-dependent hydrolase  28.4 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.954367  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3199  metal-dependent hydrolase  28.14 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3261  metal-dependent hydrolase  28.14 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3208  metal-dependent hydrolase  28.14 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1791  hypothetical protein  27.18 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000624384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2822  hypothetical protein  28.89 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000149451  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3135  hypothetical protein  29.3 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3688  metal-dependent hydrolase-like protein  29.59 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4526  metal-dependent hydrolase-like  29.59 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3837  metal-dependent hydrolase-like protein  29.59 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0372117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3084  hypothetical protein  30.46 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.531586  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2354  hypothetical protein  33.52 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19546  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2259  metal-dependent hydrolase-like  29.59 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0372522  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2446  hypothetical protein  29.1 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1350  FF domain-containing protein  28.62 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.0894985 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1250  metal-dependent hydrolase  29.1 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1177  hypothetical protein  29.1 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1703  hypothetical protein  29.1 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0723  hypothetical protein  29.1 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292888  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1143  metal-dependent hydrolase  28.16 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316817  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0738  hypothetical protein  29.1 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4877  membrane protein  26.76 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000561399  normal  0.621694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3692  metal-dependent hydrolase  28.16 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4676  metal-dependent hydrolase  28.16 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5624  metal-dependent hydrolase  28.16 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4528  metal-dependent hydrolase  28 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0738  metal-dependent hydrolase  28.7 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0667904 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3737  metal-dependent hydrolase-like protein  28.78 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5561  metal-dependent hydrolase-like protein  28.98 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4904  metal-dependent hydrolase-like protein  29.05 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  hitchhiker  0.000304166 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2523  hypothetical protein  26.62 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0560  hypothetical protein  26.62 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1345  hypothetical protein  26.62 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1268  hypothetical protein  26.62 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1007  metal-dependent hydrolase  26.62 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4095  hypothetical protein  28.1 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440688  normal  0.496826 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1473  hypothetical protein  27.69 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1556  hypothetical protein  28.62 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0169  hypothetical protein  27.18 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0906  hypothetical protein  26.45 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1341  hypothetical protein  27.18 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2739  hypothetical protein  27.18 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.910549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2472  hypothetical protein  26.45 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2596  hypothetical protein  27.18 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0196  hypothetical protein  27.18 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>