121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1360 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1360  metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 298 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1296  FF domain protein  97.32 
 
 		 298 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0684567  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2173  hypothetical protein  75.92 
 
 		 302 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425702  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1809  FF domain-containing protein  75 
 
 		 302 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0912  hypothetical protein  75.59 
 
 		 302 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0391882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0819  hypothetical protein  75.92 
 
 		 302 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0708  metal-dependent hydrolase  79.02 
 
 		 301 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4970  metal-dependent hydrolase  77.74 
 
 		 301 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3397  metal-dependent hydrolase  77.4 
 
 		 312 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5316  metal-dependent hydrolase  77.74 
 
 		 301 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.14239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3648  metal-dependent hydrolase  77.4 
 
 		 301 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4392  metal-dependent hydrolase  76.71 
 
 		 301 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4911  metal-dependent hydrolase  76.71 
 
 		 301 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0221  hypothetical protein  74.83 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1062  hypothetical protein  74.83 
 
 		 300 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1193  FF domain-containing protein  73.2 
 
 		 440 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0958504  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0052  hypothetical protein  74.83 
 
 		 300 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0366  hypothetical protein  74.83 
 
 		 300 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1638  hypothetical protein  75.17 
 
 		 300 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1219  hypothetical protein  74.83 
 
 		 300 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1727  hypothetical protein  74.48 
 
 		 300 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21040  hypothetical protein  49.65 
 
 		 295 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1795  hypothetical protein  48.41 
 
 		 295 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8730  hypothetical protein  47 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12790  hypothetical protein  42.2 
 
 		 356 aa  239  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.89049  normal  0.675408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0453  hypothetical protein  44.32 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0464  hypothetical protein  44.32 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.416793  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0440  hypothetical protein  44.32 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0478  Uncharacterized conserved protein UCP07580  42.11 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2251  putative metal-dependent hydrolase  42.91 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000117397  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4340  hypothetical protein  41.7 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3179  hypothetical protein  40.14 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.17273  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1093  Uncharacterized conserved protein UCP07580  40.28 
 
 		 293 aa  208  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2874  hypothetical protein  38.36 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2918  hypothetical protein  38.36 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2904  hypothetical protein  38.36 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3425  hypothetical protein  40.36 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2618  metal-dependent hydrolase-like protein  28.26 
 
 		 278 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00276728  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44510  hypothetical protein  30.53 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.319734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3790  hypothetical protein  31.18 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0165  hypothetical protein  26.84 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1930  metal-dependent hydrolase-like protein  30.74 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5371  hypothetical protein  30.51 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.971328 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2960  hypothetical protein  27.24 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0314  metal-dependent hydrolase  31.75 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4593  metal-dependent hydrolase  31.28 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53530  hypothetical protein  27.82 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4691  hypothetical protein  31.19 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2091  metal-dependent hydrolase  29.79 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4513  metal-dependent hydrolase  29.04 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4629  metal-dependent hydrolase  31.75 
 
 		 289 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3654  metal-dependent hydrolase-like protein  30.88 
 
 		 281 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5624  metal-dependent hydrolase  29.02 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3692  metal-dependent hydrolase  28.67 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4676  metal-dependent hydrolase  28.67 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1143  metal-dependent hydrolase  28.67 
 
 		 301 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316817  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4528  metal-dependent hydrolase  28.67 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4070  metal-dependent hydrolase  29.37 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.954367  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3653  metal-dependent hydrolase-like protein  29.95 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3199  metal-dependent hydrolase  26.64 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3261  metal-dependent hydrolase  26.64 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3208  metal-dependent hydrolase  26.64 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4017  metal-dependent hydrolase  28.32 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279425  normal  0.558393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2354  hypothetical protein  33.16 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19546  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1473  hypothetical protein  28.32 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4103  FF domain-containing protein  27.46 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.852892  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0169  hypothetical protein  28 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1341  hypothetical protein  28 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2739  hypothetical protein  28 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.910549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2596  hypothetical protein  28 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0196  hypothetical protein  28 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2523  hypothetical protein  28.62 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0560  hypothetical protein  28.62 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1345  hypothetical protein  28.62 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1007  metal-dependent hydrolase  28.62 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1012  hypothetical protein  28.36 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2259  metal-dependent hydrolase-like  28.72 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0372522  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4526  metal-dependent hydrolase-like  29.81 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3837  metal-dependent hydrolase-like protein  29.81 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0372117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3688  metal-dependent hydrolase-like protein  29.81 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4877  membrane protein  26.49 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000561399  normal  0.621694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0083  metal-dependent hydrolase-like protein  30.14 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0738  metal-dependent hydrolase  28.89 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0667904 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0463  hypothetical protein  27.57 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1250  metal-dependent hydrolase  29.43 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1177  hypothetical protein  29.43 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2446  hypothetical protein  29.43 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1268  hypothetical protein  29.08 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3737  metal-dependent hydrolase-like protein  25.37 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4904  metal-dependent hydrolase-like protein  26.88 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  hitchhiker  0.000304166 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0723  hypothetical protein  29.43 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292888  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1791  hypothetical protein  26.28 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000624384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5561  metal-dependent hydrolase-like protein  26.74 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0738  hypothetical protein  29.43 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1703  hypothetical protein  29.43 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1556  hypothetical protein  28.96 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1350  FF domain-containing protein  30.05 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.0894985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3135  hypothetical protein  28.1 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2822  hypothetical protein  29.63 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000149451  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3015  FF domain protein  27.43 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>