121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0819 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2173  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  624  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425702  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0819  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  624  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0912  hypothetical protein  99.34 
 
 
302 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0391882  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1809  FF domain-containing protein  93.69 
 
 
302 aa  591  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0708  metal-dependent hydrolase  81.06 
 
 
301 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5316  metal-dependent hydrolase  80.73 
 
 
301 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.14239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3397  metal-dependent hydrolase  80.73 
 
 
312 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4970  metal-dependent hydrolase  81.06 
 
 
301 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4392  metal-dependent hydrolase  80.4 
 
 
301 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3648  metal-dependent hydrolase  81.14 
 
 
301 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4911  metal-dependent hydrolase  79.93 
 
 
301 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562642  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1296  FF domain protein  76.25 
 
 
298 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0684567  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1360  metal-dependent hydrolase  75.92 
 
 
298 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0221  hypothetical protein  74.49 
 
 
434 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1062  hypothetical protein  74.49 
 
 
300 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0052  hypothetical protein  74.49 
 
 
300 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0366  hypothetical protein  74.49 
 
 
300 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1638  hypothetical protein  74.83 
 
 
300 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1219  hypothetical protein  74.49 
 
 
300 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1727  hypothetical protein  74.15 
 
 
300 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1193  FF domain-containing protein  73.47 
 
 
440 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0958504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21040  hypothetical protein  47.44 
 
 
295 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1795  hypothetical protein  48.21 
 
 
295 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8730  hypothetical protein  43.46 
 
 
301 aa  232  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12790  hypothetical protein  38.73 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.89049  normal  0.675408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4340  hypothetical protein  39.93 
 
 
306 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0478  Uncharacterized conserved protein UCP07580  40.14 
 
 
298 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0453  hypothetical protein  42.18 
 
 
302 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0464  hypothetical protein  42.18 
 
 
302 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.416793  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0440  hypothetical protein  42.18 
 
 
302 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2251  putative metal-dependent hydrolase  40.53 
 
 
311 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000117397  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3179  hypothetical protein  38.62 
 
 
300 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.17273  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2874  hypothetical protein  37.46 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2918  hypothetical protein  37.46 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2904  hypothetical protein  37.46 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1093  Uncharacterized conserved protein UCP07580  38.16 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3425  hypothetical protein  38.43 
 
 
300 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2618  metal-dependent hydrolase-like protein  30.18 
 
 
278 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00276728  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44510  hypothetical protein  29.81 
 
 
278 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.319734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3790  hypothetical protein  29.32 
 
 
278 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0314  metal-dependent hydrolase  32.38 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2960  hypothetical protein  29.75 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4593  metal-dependent hydrolase  31.9 
 
 
289 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1930  metal-dependent hydrolase-like protein  28.83 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.242298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0165  hypothetical protein  29.86 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4629  metal-dependent hydrolase  31.43 
 
 
289 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4691  hypothetical protein  30.28 
 
 
277 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53530  hypothetical protein  30.28 
 
 
277 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000569349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5371  hypothetical protein  31.05 
 
 
311 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.971328 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4513  metal-dependent hydrolase  28.62 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2091  metal-dependent hydrolase  30 
 
 
272 aa  89  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2354  hypothetical protein  33.83 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19546  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3654  metal-dependent hydrolase-like protein  27.44 
 
 
281 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3135  hypothetical protein  29.55 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3199  metal-dependent hydrolase  27.55 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3261  metal-dependent hydrolase  27.55 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604698  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3208  metal-dependent hydrolase  27.55 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3653  metal-dependent hydrolase-like protein  28.41 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0738  metal-dependent hydrolase  29.77 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0667904 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3362  FF domain protein  28.47 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270556  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3015  FF domain protein  28.47 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0083  metal-dependent hydrolase-like protein  28.51 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4103  FF domain-containing protein  31.47 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.852892  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2822  hypothetical protein  28.21 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000149451  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1350  FF domain-containing protein  31.02 
 
 
287 aa  72.4  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.0894985 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3084  hypothetical protein  30.3 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.531586  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4095  hypothetical protein  28.22 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440688  normal  0.496826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2259  metal-dependent hydrolase-like  26.82 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0372522  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4526  metal-dependent hydrolase-like  27.44 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3837  metal-dependent hydrolase-like protein  27.44 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0372117  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3688  metal-dependent hydrolase-like protein  27.44 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4017  metal-dependent hydrolase  26.67 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279425  normal  0.558393 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0169  hypothetical protein  28.28 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1012  hypothetical protein  28.28 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5624  metal-dependent hydrolase  27.34 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3692  metal-dependent hydrolase  27.34 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4676  metal-dependent hydrolase  27.34 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1341  hypothetical protein  28.28 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2739  hypothetical protein  28.28 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.910549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2596  hypothetical protein  28.28 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0196  hypothetical protein  28.28 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4070  metal-dependent hydrolase  26.19 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.954367  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0463  hypothetical protein  31.75 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1143  metal-dependent hydrolase  26.95 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316817  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4877  membrane protein  25 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000561399  normal  0.621694 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1791  hypothetical protein  26.1 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000624384 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0303  hypothetical protein  31.31 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1473  hypothetical protein  27.67 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4528  metal-dependent hydrolase  25.49 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0932  FF domain-containing protein  26.14 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2523  hypothetical protein  26.91 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0555  hypothetical protein  26.18 
 
 
302 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0628824  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3601  FF domain-containing protein  29.3 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0560  hypothetical protein  26.91 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1345  hypothetical protein  26.91 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3559  hypothetical protein  27.37 
 
 
312 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0540569  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1268  hypothetical protein  26.91 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1007  metal-dependent hydrolase  26.91 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4904  metal-dependent hydrolase-like protein  29.83 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  hitchhiker  0.000304166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3497  hypothetical protein  28.42 
 
 
311 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270685  normal  0.173703 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>