120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4526 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4526  metal-dependent hydrolase-like  100 
 
 
305 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3837  metal-dependent hydrolase-like protein  100 
 
 
305 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0372117  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3688  metal-dependent hydrolase-like protein  100 
 
 
305 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2259  metal-dependent hydrolase-like  98.36 
 
 
307 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0372522  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3737  metal-dependent hydrolase-like protein  87.95 
 
 
307 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5561  metal-dependent hydrolase-like protein  87.95 
 
 
307 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4904  metal-dependent hydrolase-like protein  89.47 
 
 
303 aa  519  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  hitchhiker  0.000304166 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0906  hypothetical protein  76.62 
 
 
302 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0555  hypothetical protein  76.98 
 
 
302 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0628824  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2610  hypothetical protein  76.62 
 
 
302 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2472  hypothetical protein  76.62 
 
 
302 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1791  hypothetical protein  70.57 
 
 
293 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000624384 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4877  membrane protein  69.82 
 
 
293 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000561399  normal  0.621694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4017  metal-dependent hydrolase  66.55 
 
 
301 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279425  normal  0.558393 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4070  metal-dependent hydrolase  65.45 
 
 
301 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.954367  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5624  metal-dependent hydrolase  65.81 
 
 
301 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3692  metal-dependent hydrolase  66.17 
 
 
301 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4676  metal-dependent hydrolase  66.17 
 
 
301 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1143  metal-dependent hydrolase  61.33 
 
 
301 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316817  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1473  hypothetical protein  64.36 
 
 
304 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4528  metal-dependent hydrolase  65.44 
 
 
301 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2523  hypothetical protein  64 
 
 
304 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0560  hypothetical protein  64 
 
 
304 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1345  hypothetical protein  64 
 
 
304 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1007  metal-dependent hydrolase  64 
 
 
304 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1268  hypothetical protein  64.44 
 
 
298 aa  361  9e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0463  hypothetical protein  58.21 
 
 
301 aa  332  6e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0169  hypothetical protein  57.86 
 
 
296 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1341  hypothetical protein  57.86 
 
 
296 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2739  hypothetical protein  57.86 
 
 
296 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.910549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2596  hypothetical protein  57.86 
 
 
296 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0196  hypothetical protein  57.86 
 
 
296 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1012  hypothetical protein  56.99 
 
 
284 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3601  FF domain-containing protein  57.62 
 
 
290 aa  302  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2446  hypothetical protein  52.43 
 
 
294 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1177  hypothetical protein  52.43 
 
 
306 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1703  hypothetical protein  52.06 
 
 
294 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0723  hypothetical protein  52.06 
 
 
306 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292888  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1556  hypothetical protein  52.43 
 
 
294 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0738  hypothetical protein  52.06 
 
 
306 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1250  metal-dependent hydrolase  52.06 
 
 
306 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3015  FF domain protein  51.37 
 
 
298 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3362  FF domain protein  52.05 
 
 
298 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270556  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2091  metal-dependent hydrolase  43.94 
 
 
272 aa  198  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3653  metal-dependent hydrolase-like protein  41.32 
 
 
284 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3654  metal-dependent hydrolase-like protein  38.91 
 
 
281 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4691  hypothetical protein  42.7 
 
 
277 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1930  metal-dependent hydrolase-like protein  43.63 
 
 
293 aa  186  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.242298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53530  hypothetical protein  42.7 
 
 
277 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000569349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3790  hypothetical protein  40.52 
 
 
278 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0165  hypothetical protein  38.81 
 
 
297 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4103  FF domain-containing protein  40.3 
 
 
285 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.852892  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2618  metal-dependent hydrolase-like protein  38.89 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00276728  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44510  hypothetical protein  40.22 
 
 
278 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.319734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0083  metal-dependent hydrolase-like protein  38.91 
 
 
282 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4513  metal-dependent hydrolase  39.76 
 
 
285 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0738  metal-dependent hydrolase  39.06 
 
 
297 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0667904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2960  hypothetical protein  35.69 
 
 
291 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1350  FF domain-containing protein  34.3 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.0894985 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4593  metal-dependent hydrolase  36.36 
 
 
289 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4629  metal-dependent hydrolase  37.45 
 
 
289 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0314  metal-dependent hydrolase  37.16 
 
 
289 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2084  FF domain-containing protein  33.45 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3199  metal-dependent hydrolase  35.29 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3261  metal-dependent hydrolase  35.29 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604698  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3208  metal-dependent hydrolase  35.29 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2822  hypothetical protein  38.74 
 
 
267 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000149451  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0932  FF domain-containing protein  34.04 
 
 
294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438166  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2354  hypothetical protein  36.5 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19546  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5371  hypothetical protein  38.27 
 
 
311 aa  116  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.971328 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3135  hypothetical protein  35.27 
 
 
300 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12790  hypothetical protein  30.5 
 
 
356 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.89049  normal  0.675408 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3084  hypothetical protein  27.24 
 
 
296 aa  89.7  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.531586  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2251  putative metal-dependent hydrolase  28 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000117397  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4392  metal-dependent hydrolase  29.59 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1296  FF domain protein  30.77 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0684567  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3397  metal-dependent hydrolase  30.08 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4911  metal-dependent hydrolase  28.52 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562642  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4340  hypothetical protein  28.63 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3648  metal-dependent hydrolase  30.16 
 
 
301 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1360  metal-dependent hydrolase  29.81 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4970  metal-dependent hydrolase  29.7 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5316  metal-dependent hydrolase  29.7 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.14239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0708  metal-dependent hydrolase  28.52 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2874  hypothetical protein  30.38 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2918  hypothetical protein  30.38 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2904  hypothetical protein  30.38 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0453  hypothetical protein  31.46 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0464  hypothetical protein  31.46 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.416793  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0440  hypothetical protein  31.46 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1062  hypothetical protein  30.51 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0052  hypothetical protein  30.51 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0366  hypothetical protein  30.51 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1219  hypothetical protein  30.51 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0221  hypothetical protein  30.51 
 
 
434 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1727  hypothetical protein  29.41 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02367  hypothetical protein  30.17 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.117709 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1193  FF domain-containing protein  27.94 
 
 
440 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0958504  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1809  FF domain-containing protein  27.7 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1638  hypothetical protein  29.41 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>