120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4070 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4070  metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 301 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.954367  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4017  metal-dependent hydrolase  91.36 
 
 		 301 aa  584  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279425  normal  0.558393 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1143  metal-dependent hydrolase  91.03 
 
 		 301 aa  577  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316817  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3692  metal-dependent hydrolase  91.03 
 
 		 301 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4676  metal-dependent hydrolase  91.03 
 
 		 301 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5624  metal-dependent hydrolase  91.36 
 
 		 301 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4528  metal-dependent hydrolase  90.7 
 
 		 301 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1473  hypothetical protein  85.47 
 
 		 304 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2523  hypothetical protein  82.33 
 
 		 304 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0560  hypothetical protein  82.33 
 
 		 304 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1345  hypothetical protein  82.33 
 
 		 304 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1007  metal-dependent hydrolase  82.33 
 
 		 304 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1268  hypothetical protein  82.31 
 
 		 298 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1791  hypothetical protein  75.81 
 
 		 293 aa  441  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000624384 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0169  hypothetical protein  70.41 
 
 		 296 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1341  hypothetical protein  70.41 
 
 		 296 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2739  hypothetical protein  70.41 
 
 		 296 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.910549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2596  hypothetical protein  70.41 
 
 		 296 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0196  hypothetical protein  70.41 
 
 		 296 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4877  membrane protein  72.57 
 
 		 293 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000561399  normal  0.621694 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0463  hypothetical protein  70.41 
 
 		 301 aa  431  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1012  hypothetical protein  69.23 
 
 		 284 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1556  hypothetical protein  62.07 
 
 		 294 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2446  hypothetical protein  61.03 
 
 		 294 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2259  metal-dependent hydrolase-like  63.19 
 
 		 307 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0372522  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4526  metal-dependent hydrolase-like  65.45 
 
 		 305 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3737  metal-dependent hydrolase-like protein  66.06 
 
 		 307 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3837  metal-dependent hydrolase-like protein  65.45 
 
 		 305 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0372117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1177  hypothetical protein  61.03 
 
 		 306 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3688  metal-dependent hydrolase-like protein  65.45 
 
 		 305 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0723  hypothetical protein  60.69 
 
 		 306 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0738  hypothetical protein  60.69 
 
 		 306 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1250  metal-dependent hydrolase  60.69 
 
 		 306 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1703  hypothetical protein  60.69 
 
 		 294 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5561  metal-dependent hydrolase-like protein  65.33 
 
 		 307 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4904  metal-dependent hydrolase-like protein  64.21 
 
 		 303 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  hitchhiker  0.000304166 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0906  hypothetical protein  60.9 
 
 		 302 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2610  hypothetical protein  60.9 
 
 		 302 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2472  hypothetical protein  60.9 
 
 		 302 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0555  hypothetical protein  60.21 
 
 		 302 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0628824  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3601  FF domain-containing protein  58.51 
 
 		 290 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3015  FF domain protein  54.86 
 
 		 298 aa  298  9e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3362  FF domain protein  54.86 
 
 		 298 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2618  metal-dependent hydrolase-like protein  44.27 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00276728  normal  0.902339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1930  metal-dependent hydrolase-like protein  44.09 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44510  hypothetical protein  43.73 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.319734 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0165  hypothetical protein  42.75 
 
 		 297 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3790  hypothetical protein  42.59 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53530  hypothetical protein  41.61 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4691  hypothetical protein  41.61 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4103  FF domain-containing protein  41.85 
 
 		 285 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.852892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2091  metal-dependent hydrolase  40.36 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3654  metal-dependent hydrolase-like protein  40.82 
 
 		 281 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3653  metal-dependent hydrolase-like protein  38.93 
 
 		 284 aa  178  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0083  metal-dependent hydrolase-like protein  37.27 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2960  hypothetical protein  34.35 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4513  metal-dependent hydrolase  38.19 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4593  metal-dependent hydrolase  35.96 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0932  FF domain-containing protein  37.45 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438166  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4629  metal-dependent hydrolase  36.09 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0314  metal-dependent hydrolase  35.61 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0738  metal-dependent hydrolase  36.15 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0667904 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3199  metal-dependent hydrolase  33.09 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3261  metal-dependent hydrolase  33.09 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3208  metal-dependent hydrolase  33.09 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2822  hypothetical protein  38.43 
 
 		 267 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000149451  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2084  FF domain-containing protein  34.31 
 
 		 296 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1350  FF domain-containing protein  35.19 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.0894985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5371  hypothetical protein  34.54 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.971328 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2354  hypothetical protein  33.83 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19546  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3135  hypothetical protein  31.36 
 
 		 300 aa  105  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8730  hypothetical protein  31.41 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0453  hypothetical protein  30.85 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0464  hypothetical protein  30.85 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.416793  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0440  hypothetical protein  30.85 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4340  hypothetical protein  31.71 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12790  hypothetical protein  29.55 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.89049  normal  0.675408 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3084  hypothetical protein  26.32 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.531586  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4392  metal-dependent hydrolase  28.4 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1360  metal-dependent hydrolase  29.37 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1296  FF domain protein  28.93 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0684567  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4911  metal-dependent hydrolase  28.8 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2251  putative metal-dependent hydrolase  26.35 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000117397  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1093  Uncharacterized conserved protein UCP07580  31.12 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1795  hypothetical protein  28.11 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21040  hypothetical protein  29.04 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3648  metal-dependent hydrolase  26.97 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2874  hypothetical protein  27.71 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2918  hypothetical protein  27.71 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2904  hypothetical protein  27.71 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3397  metal-dependent hydrolase  28.69 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4970  metal-dependent hydrolase  28.69 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5316  metal-dependent hydrolase  28.69 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.14239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3179  hypothetical protein  27.78 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.17273  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0708  metal-dependent hydrolase  27.87 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3425  hypothetical protein  26.48 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02367  hypothetical protein  31.36 
 
 		 250 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117709 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1193  FF domain-containing protein  27.02 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0958504  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0912  hypothetical protein  26.59 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0391882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1727  hypothetical protein  26.56 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>