30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2284 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2284  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 422 aa  823    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3687  tetratricopeptide TPR_2  23.65 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1927  tetratricopeptide TPR_2  23.5 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 1421 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.13 
 
 		 247 aa  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.52 
 
 		 632 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.84 
 
 		 810 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 878 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 1276 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  29.17 
 
 		 815 aa  48.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  21.28 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 224 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  32.99 
 
 		 395 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  28.46 
 
 		 349 aa  46.6  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 3145 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 643 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  37.36 
 
 		 884 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 716 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 543 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1746  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 254 aa  43.9  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.08 
 
 		 156 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  26.32 
 
 		 681 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  26.85 
 
 		 1101 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 156 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  28.44 
 
 		 391 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  29.35 
 
 		 743 aa  43.5  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 1049 aa  43.1  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 301 aa  43.1  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>