216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2267 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2267  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 383 aa  765    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0049  flagellar basal body P-ring protein  44.41 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0829396  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  44.83 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  42.78 
 
 		 367 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  43.68 
 
 		 365 aa  276  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  41.44 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  44.13 
 
 		 368 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  42.16 
 
 		 364 aa  271  9e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  44.83 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  43.23 
 
 		 371 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  43.35 
 
 		 378 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16540  flagellar P-ring protein  42.98 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000030523  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  44.7 
 
 		 370 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  41.78 
 
 		 380 aa  262  6e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  41.78 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  44.38 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  43.06 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  40.43 
 
 		 370 aa  256  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  41.5 
 
 		 398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  41.99 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  44.51 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  39.89 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  41.01 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  42.86 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1144  flagellar P-ring protein  44.83 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000168171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  40.92 
 
 		 398 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1348  flagellar basal body P-ring protein  43.35 
 
 		 371 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0028496  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  41.31 
 
 		 363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  42.82 
 
 		 374 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  41.95 
 
 		 377 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  41.55 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  41.55 
 
 		 392 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  41.53 
 
 		 363 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  40.66 
 
 		 391 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  41.5 
 
 		 373 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  40.67 
 
 		 391 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  40.67 
 
 		 391 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  41.38 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  43.43 
 
 		 386 aa  247  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  41.58 
 
 		 365 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  40 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  41.55 
 
 		 363 aa  246  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  42.02 
 
 		 368 aa  246  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  40.63 
 
 		 373 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  40.79 
 
 		 373 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  41.55 
 
 		 363 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  43.23 
 
 		 374 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  41.4 
 
 		 374 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  42.9 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  40.05 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  40.44 
 
 		 392 aa  243  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  39.26 
 
 		 378 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  40.78 
 
 		 401 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  40.78 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  42.09 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  39.42 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  41.62 
 
 		 361 aa  242  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  42.17 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  42.22 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  40.5 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  41.41 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  40.5 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  40.5 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  40.28 
 
 		 400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  40.5 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  40.28 
 
 		 401 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  40.48 
 
 		 376 aa  239  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  40.48 
 
 		 363 aa  239  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  40.74 
 
 		 369 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  40.74 
 
 		 369 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2926  flagellar basal body P-ring protein  40.52 
 
 		 351 aa  238  9e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.625309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  41.31 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  40.77 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  39.84 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  41.53 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  38.73 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  41.31 
 
 		 375 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  41.85 
 
 		 363 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  41.85 
 
 		 363 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  43.14 
 
 		 374 aa  237  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  41.85 
 
 		 363 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  41.85 
 
 		 363 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  39.57 
 
 		 371 aa  236  4e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  43.13 
 
 		 379 aa  236  7e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  41.03 
 
 		 377 aa  236  7e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  40.58 
 
 		 372 aa  235  9e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  40 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  39.79 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  39.63 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  40.71 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1253  flagellar basal body P-ring protein  37.86 
 
 		 331 aa  233  5e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  40.73 
 
 		 363 aa  233  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1202  flagellar basal body P-ring protein  37.86 
 
 		 331 aa  233  5e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  40.32 
 
 		 384 aa  233  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  38.52 
 
 		 369 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  42.36 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  39.43 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  40.73 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  39.44 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  40.46 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>