More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0127 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
332 aa  671    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0360  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.92 
 
 
325 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1909  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.31 
 
 
329 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260118  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0464  alcohol dehydrogenase  58.77 
 
 
325 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0490  alcohol dehydrogenase  58.77 
 
 
325 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.395671  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2615  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.77 
 
 
329 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00219315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3580  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.15 
 
 
325 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1779  alcohol dehydrogenase  60.31 
 
 
321 aa  360  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.2 
 
 
325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4742  alcohol dehydrogenase  53.7 
 
 
344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1926  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.45 
 
 
338 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0749447  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0239  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  44.34 
 
 
321 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.46 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4095  alcohol dehydrogenase  41.86 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4656  oxidoreductase  37.54 
 
 
319 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53110  oxidoreductase  37.3 
 
 
319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0207  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.31 
 
 
327 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404543  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3759  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.05 
 
 
318 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4732  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.48 
 
 
328 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  29.78 
 
 
331 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  30 
 
 
331 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.25 
 
 
331 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.46 
 
 
327 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.47 
 
 
331 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.72 
 
 
335 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  29.72 
 
 
335 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6116  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.87 
 
 
326 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.15 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0192  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.75 
 
 
323 aa  96.7  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.28 
 
 
335 aa  96.3  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5294  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.67 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2768  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.89 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85677  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.48 
 
 
328 aa  94  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6360  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.23 
 
 
323 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398361  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.09 
 
 
326 aa  93.6  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.66 
 
 
326 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.91 
 
 
307 aa  93.2  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7480  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.59 
 
 
328 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3312  alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 
320 aa  92.8  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8677  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.71 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  33.46 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2788  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.72 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.147926  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2447  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.38 
 
 
336 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.03 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
321 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0255  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
336 aa  90.1  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  31.67 
 
 
331 aa  89.4  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2634  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.95 
 
 
336 aa  89.4  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.36 
 
 
322 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10198  ripening-induced protein-putative Zn-containing oxidoreductase  28.53 
 
 
329 aa  88.6  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.622763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0991  oxidoreductase, zinc-binding  32.13 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0216  putative zinc-binding oxidoreductase  34.89 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.591526 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.2 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.25 
 
 
339 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  33.2 
 
 
322 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.44 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3826  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30 
 
 
311 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.0906959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5758  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
328 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0529264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  30.89 
 
 
332 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.6 
 
 
332 aa  87  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 
337 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.61 
 
 
335 aa  86.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2970  Beta-ketoacyl synthase  30.72 
 
 
1841 aa  86.3  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000966236 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  27.74 
 
 
328 aa  86.3  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.8 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.27 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1367  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9935  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  32.93 
 
 
2020 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1273  putative oxidoreductase  29.13 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  29.07 
 
 
2225 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0364  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.74 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.99 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3833  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.65 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0066  alcohol dehydrogenase  30.1 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2551  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.8 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7910  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.35 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.31 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  28.48 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.27 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  27.55 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.75 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1670  alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000446585  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2517  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.61 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0419474  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 
347 aa  82.4  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2962  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.78 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0908674 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5053  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.21 
 
 
324 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3282  alcohol dehydrogenase  27.19 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3808  alcohol dehydrogenase  30.1 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  29.18 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.31 
 
 
329 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>