More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0207 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0207  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
327 aa  617  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404543  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.98 
 
 
321 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0239  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  43.6 
 
 
321 aa  225  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4095  alcohol dehydrogenase  42.99 
 
 
318 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4742  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
344 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1926  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.5 
 
 
338 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0749447  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3580  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.39 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0490  alcohol dehydrogenase  39.41 
 
 
325 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.395671  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2615  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.41 
 
 
329 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00219315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0464  alcohol dehydrogenase  39.41 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1779  alcohol dehydrogenase  40.07 
 
 
321 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0360  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.58 
 
 
325 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1909  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 
329 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260118  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4656  oxidoreductase  37.96 
 
 
319 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.28 
 
 
335 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.31 
 
 
332 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53110  oxidoreductase  36.84 
 
 
319 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.5 
 
 
325 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.95 
 
 
322 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
325 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  34.72 
 
 
326 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.14 
 
 
326 aa  149  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6360  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.12 
 
 
323 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398361  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3282  alcohol dehydrogenase  31.97 
 
 
333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3759  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.8 
 
 
318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5294  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.8 
 
 
323 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.72 
 
 
335 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.43 
 
 
324 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4404  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  33.43 
 
 
337 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.880778 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.52 
 
 
324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49690  oxidoreductase  31.44 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0935  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.95 
 
 
329 aa  139  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000152642 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  29.94 
 
 
328 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5053  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.19 
 
 
324 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.42 
 
 
342 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.24 
 
 
328 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
328 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.24 
 
 
328 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4281  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
344 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.672706  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3311  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.65 
 
 
329 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  30.24 
 
 
328 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.17 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  29.94 
 
 
328 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.24 
 
 
328 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.13 
 
 
327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.93 
 
 
334 aa  133  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.04 
 
 
327 aa  132  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  29.88 
 
 
336 aa  132  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  29.88 
 
 
336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.88 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.32 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  29.64 
 
 
328 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  29.64 
 
 
328 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29 
 
 
328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.43 
 
 
336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.72 
 
 
332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  35.54 
 
 
328 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3044  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.39 
 
 
369 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0180  alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
329 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.089146  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.94 
 
 
328 aa  129  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.74 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0170  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.83 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2736  alcohol dehydrogenase  29.61 
 
 
328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00823064  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  32.42 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35 
 
 
322 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1054  alcohol dehydrogenase  28.19 
 
 
332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  30.64 
 
 
345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5183  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  32.02 
 
 
333 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.641373  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1382  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.54 
 
 
324 aa  126  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 
334 aa  126  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  32.43 
 
 
338 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 
339 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.72 
 
 
328 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.66 
 
 
346 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.42 
 
 
350 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0529  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.84 
 
 
325 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  30.21 
 
 
325 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.56 
 
 
327 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2169  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.55 
 
 
339 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0111433  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3808  alcohol dehydrogenase  31.85 
 
 
323 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2290  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
339 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.02 
 
 
326 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2065  putative NADPH quinone oxidoreductase protein  31.75 
 
 
334 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.465224  normal  0.69391 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  30.75 
 
 
389 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.21 
 
 
328 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.83 
 
 
335 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.63 
 
 
336 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.2 
 
 
334 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.75 
 
 
324 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0290  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.83 
 
 
329 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6140  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.24 
 
 
328 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  32.42 
 
 
325 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  30.45 
 
 
327 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.7 
 
 
337 aa  122  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.67 
 
 
331 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  28.49 
 
 
331 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  28.49 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.05 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>