More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1926 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1926  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
338 aa  671    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0749447  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4742  alcohol dehydrogenase  67.07 
 
 
344 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694305 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0360  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.09 
 
 
325 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2615  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.71 
 
 
329 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00219315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0490  alcohol dehydrogenase  54.94 
 
 
325 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.395671  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1909  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.19 
 
 
329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260118  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1779  alcohol dehydrogenase  54.66 
 
 
321 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0464  alcohol dehydrogenase  54.01 
 
 
325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3580  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.01 
 
 
325 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.45 
 
 
332 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.23 
 
 
325 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0239  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  44.19 
 
 
321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.95 
 
 
321 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0207  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.5 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404543  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4095  alcohol dehydrogenase  40 
 
 
318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4656  oxidoreductase  37.93 
 
 
319 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53110  oxidoreductase  38.44 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3759  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.2 
 
 
318 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  32.42 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.42 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.74 
 
 
325 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 
326 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  31.73 
 
 
325 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
325 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.63 
 
 
325 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5294  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.92 
 
 
323 aa  92.8  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.89 
 
 
336 aa  92.8  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
325 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2768  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
343 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.69 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3833  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.26 
 
 
343 aa  90.5  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6360  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.48 
 
 
323 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398361  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.33 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  30.87 
 
 
2220 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 
339 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
322 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  31.74 
 
 
331 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  33.62 
 
 
336 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.62 
 
 
336 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.72 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0617  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.8 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10198  ripening-induced protein-putative Zn-containing oxidoreductase  26.86 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.622763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  31.3 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.82 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.9 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
339 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7480  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.68 
 
 
328 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  30.03 
 
 
335 aa  87  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  28.96 
 
 
326 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1670  alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000446585  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.72 
 
 
326 aa  86.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 
325 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.52 
 
 
331 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  30.84 
 
 
325 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.63 
 
 
335 aa  85.9  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
335 aa  85.9  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.17 
 
 
331 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.19 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.13 
 
 
328 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.35 
 
 
332 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.22 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5040  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.64 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13939  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.3 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  30.84 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  34 
 
 
329 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30 
 
 
342 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  35.75 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.74 
 
 
324 aa  84  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.06 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1258  alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.03 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.71 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.7 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1367  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.73 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9935  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.19 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3022  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0720259  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  33.88 
 
 
330 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
329 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.78 
 
 
342 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4732  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.25 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0062  putative Zinc-binding dehydrogenase  28.75 
 
 
364 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.08 
 
 
342 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3808  alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1584  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  36.23 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.58 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.41 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5758  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0529264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3235  alcohol dehydrogenase  39.02 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.22268  normal  0.721044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  31.91 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.1 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  29.77 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  34.35 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.71 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1357  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.62 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>