More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3759 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3759  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
318 aa  630  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53110  oxidoreductase  70.22 
 
 
319 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4656  oxidoreductase  69.28 
 
 
319 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4095  alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 
318 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.65 
 
 
321 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0239  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 
321 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3580  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37 
 
 
325 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1779  alcohol dehydrogenase  38.64 
 
 
321 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2615  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.89 
 
 
329 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00219315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0464  alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1909  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
329 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260118  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0490  alcohol dehydrogenase  35.89 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.395671  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1926  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.14 
 
 
338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0749447  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0360  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
325 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.28 
 
 
325 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.05 
 
 
332 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4742  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
344 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694305 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0207  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404543  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.7 
 
 
322 aa  109  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1670  alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 
328 aa  103  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000446585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1367  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.54 
 
 
323 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9935  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4426  alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 
319 aa  97.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  35.4 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1189  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  29.45 
 
 
356 aa  96.7  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  34.27 
 
 
321 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
326 aa  95.9  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34 
 
 
333 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.4 
 
 
337 aa  95.1  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.26 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10070  putative zinc-dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475376  normal  0.909575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.42 
 
 
338 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0930  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.08 
 
 
328 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 
337 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.07 
 
 
332 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.07 
 
 
332 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  34.07 
 
 
332 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2816  alcohol dehydrogenase  33.2 
 
 
353 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3789  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.56 
 
 
323 aa  93.2  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.63 
 
 
332 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.47 
 
 
334 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3068  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.84 
 
 
326 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.830882 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.58 
 
 
341 aa  92.8  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.63 
 
 
332 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0066  alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 
309 aa  92.4  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.19 
 
 
332 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.63 
 
 
332 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0289  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.45 
 
 
343 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
341 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  33.33 
 
 
333 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.69 
 
 
342 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2768  alcohol dehydrogenase  38.6 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  32 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  30.71 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  30.71 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.74 
 
 
341 aa  90.9  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.86 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 
312 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
338 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0617  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.49 
 
 
330 aa  90.1  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3337  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.89 
 
 
331 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5758  alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 
328 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0529264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.76 
 
 
330 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5183  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.12 
 
 
333 aa  90.1  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.641373  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
339 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.95 
 
 
334 aa  89.7  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.94 
 
 
335 aa  89.7  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.86 
 
 
307 aa  89.7  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0954  alcohol dehydrogenase  31.95 
 
 
334 aa  89.7  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.46 
 
 
325 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
328 aa  89.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.03 
 
 
337 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 
325 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.87 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  31.73 
 
 
317 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  28.92 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.15 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.73 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  32.37 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  30.71 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  29.96 
 
 
325 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1501  alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 
324 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640721  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7910  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.68 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 
333 aa  87.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.32 
 
 
324 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0192  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.37 
 
 
323 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 
329 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.3 
 
 
332 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  33.78 
 
 
304 aa  86.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
325 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.04 
 
 
308 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.96 
 
 
324 aa  86.7  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  27.43 
 
 
327 aa  86.3  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.63 
 
 
359 aa  85.9  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.39 
 
 
317 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  33.75 
 
 
297 aa  85.9  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  29.73 
 
 
324 aa  85.9  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>