70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1055 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  100 
 
 		 275 aa  535  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  61.65 
 
 		 281 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  56.98 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  41.52 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  45.45 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  43.88 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  43.64 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  50.26 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  50.26 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  50.26 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  49.49 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  48.06 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  39.37 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  39.37 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  39.37 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  39.37 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  39.37 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  39.37 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  39.37 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  38.57 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  39.19 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  37.56 
 
 		 292 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  39.42 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1322  abortive infection protein  38.61 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5732  abortive infection protein  43.56 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51176  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1390  CAAX protease family protein  38.36 
 
 		 412 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6485  abortive infection protein  43.28 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1834  abortive infection protein  41.33 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  33.68 
 
 		 252 aa  89  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4130  abortive infection protein  34.08 
 
 		 288 aa  86.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110125  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3405  abortive infection protein  36.44 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  35.34 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5779  abortive infection protein  39.6 
 
 		 301 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4525  abortive infection protein  39.3 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3843  abortive infection protein  39.3 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  31.44 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  31.44 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  38.24 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3350  ferrous iron transport protein B  24.79 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0269256  normal  0.0624529 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  42.47 
 
 		 420 aa  52.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  31.68 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  30.69 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  31.68 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  30.69 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  37.5 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  37.21 
 
 		 420 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2327  abortive infection protein  40 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  27.01 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05801  membrane-associated protease  38.36 
 
 		 452 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  37.78 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  32.95 
 
 		 241 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  30.34 
 
 		 324 aa  45.8  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  29.23 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  34.18 
 
 		 286 aa  45.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  38.36 
 
 		 453 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  35 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0516  membrane associated protease-like  36.99 
 
 		 453 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  31.91 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  28.24 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  31.4 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1870  CAAX amino terminal protease family protein  26.53 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000233024  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  31.3 
 
 		 225 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  35.44 
 
 		 453 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2677  abortive infection protein  35.16 
 
 		 294 aa  42.7  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.850809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  31.25 
 
 		 234 aa  42.7  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  36 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  34.09 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  29.03 
 
 		 237 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  29.03 
 
 		 237 aa  42  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  36.78 
 
 		 276 aa  42  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>