42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1961 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1961  glutaredoxin 2  100 
 
 		 216 aa  443  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  47.22 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  42.86 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  42.86 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  42.86 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  42.66 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  42.66 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  42.66 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  42.2 
 
 		 215 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  43.52 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  42.2 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  41.86 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  40.09 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  39.63 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  40.76 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1801  glutaredoxin 2  38.71 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3458  GrxB family glutaredoxin  38.71 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3221  glutaredoxin 2  36.94 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1106  glutaredoxin 2  37.67 
 
 		 211 aa  148  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  32.41 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38124  predicted protein  30 
 
 		 305 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  29.05 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  29.19 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  29.03 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0190  Glutaredoxin 2-like protein  24.44 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1759  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.45 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  30.59 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1837  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.27 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1078  Glutathione S-transferase domain  26.6 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2771  Glutathione S-transferase domain protein  21.88 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  35.06 
 
 		 123 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  35.06 
 
 		 123 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  32.89 
 
 		 118 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  35.06 
 
 		 123 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  33.77 
 
 		 123 aa  42  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.42 
 
 		 230 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>