122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0135 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0135  siderophore biosynthetis protein  100 
 
 
442 aa  929    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1454  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  58.49 
 
 
496 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  56.72 
 
 
495 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1510  siderophore biosynthesis protein  56.88 
 
 
496 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2411  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  56.84 
 
 
505 aa  533  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3030  siderophore biosynthesis protein  56.44 
 
 
498 aa  530  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2708  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  57.08 
 
 
501 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  57.08 
 
 
501 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.242413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1656  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  57.08 
 
 
501 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130755 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2730  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  56.84 
 
 
501 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.100586  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2447  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  54.72 
 
 
432 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3189  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  54.72 
 
 
432 aa  477  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.603333  normal  0.0134512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2546  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  54.72 
 
 
432 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2550  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  51.89 
 
 
428 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3460  L-lysine 6-monooxygenase  51.05 
 
 
434 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2739  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  52.12 
 
 
428 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1054  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  50.93 
 
 
463 aa  449  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4294  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  49.53 
 
 
432 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093868  hitchhiker  0.0000660921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1073  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  48.12 
 
 
502 aa  438  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118854  normal  0.903474 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0286  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  50.69 
 
 
455 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0513  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  47.94 
 
 
458 aa  418  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2840  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  47.33 
 
 
442 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000828048  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0592  lysine/ornithine N-monooxygenase  47.04 
 
 
447 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.301691  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3173  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  46.48 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0197  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  46.73 
 
 
456 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0156088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1802  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.56 
 
 
496 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000066726  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2835  monooxygenase  43.79 
 
 
427 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0408  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  44.58 
 
 
431 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0659  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.86 
 
 
471 aa  353  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4057  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.27 
 
 
505 aa  346  4e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02102  hypothetical protein  39.86 
 
 
468 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0217  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.09 
 
 
502 aa  333  4e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4219  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.33 
 
 
457 aa  329  7e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3333  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.14 
 
 
449 aa  320  5e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1630  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.64 
 
 
445 aa  319  6e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1817  putative siderophore biosynthesis oxidoreductase protein  38.74 
 
 
462 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1810  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.36 
 
 
442 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633774 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0025  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.49 
 
 
437 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  32.87 
 
 
425 aa  247  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.33 
 
 
445 aa  246  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.73 
 
 
425 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.730683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.94 
 
 
442 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0711  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucD  30.54 
 
 
442 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0919  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.3 
 
 
442 aa  239  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.245016  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0783  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.54 
 
 
442 aa  239  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0280  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.98 
 
 
441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.33 
 
 
435 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3318  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.82 
 
 
441 aa  231  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00871217 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.99 
 
 
444 aa  229  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  30.53 
 
 
438 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0586  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.32 
 
 
444 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0278  siderophore biosynthesis protein IucD  31.13 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1946  hypothetical protein  29.52 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0571  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.29 
 
 
434 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0211  L-lysine 6-monooxygenase  30.86 
 
 
427 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606934  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1046  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.72 
 
 
437 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.21 
 
 
452 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3091  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.11 
 
 
454 aa  190  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.169338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1811  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  26.78 
 
 
426 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3275  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.42 
 
 
430 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2790  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  27.78 
 
 
458 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4074  L-ornithine 5-monooxygenase  27.73 
 
 
456 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0146729  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  26.9 
 
 
443 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2654  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  25.94 
 
 
445 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000731675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2095  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  27.66 
 
 
444 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1540  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.21 
 
 
458 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.310035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3060  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.27 
 
 
439 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1345  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  28.7 
 
 
446 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865314  normal  0.202415 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1561  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.27 
 
 
458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000104933  normal  0.191057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2660  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  26.83 
 
 
448 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0527  l-ornithine 5-monooxygenase  26.59 
 
 
456 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1869  putative peptide monooxygenase  26.4 
 
 
438 aa  153  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3740  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  26.29 
 
 
439 aa  153  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6320  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.61 
 
 
446 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2151  lysine/ornithine N-monooxygenase  26.71 
 
 
431 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.115188 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2090  l-ornithine 5-monooxygenase  27.7 
 
 
495 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869348  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4789  lysine/ornithine N-monooxygenase  26.65 
 
 
458 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00013329  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1623  l-ornithine 5-monooxygenase  27.87 
 
 
468 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0286  l-ornithine 5-monooxygenase  27.9 
 
 
517 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0287172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1929  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  27.63 
 
 
468 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0875  l-ornithine 5-monooxygenase  27.87 
 
 
468 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635923  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1973  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  28.38 
 
 
444 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0295223 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1179  l-ornithine 5-monooxygenase  27.87 
 
 
468 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0820477  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1944  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  27.63 
 
 
468 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5066  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.47 
 
 
442 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1618  lysine/ornithine N-monooxygenase  26.95 
 
 
458 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00185713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2120  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  27.31 
 
 
444 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0401511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2871  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  26.32 
 
 
438 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774332  normal  0.562088 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2416  l-ornithine 5-monooxygenase  27.29 
 
 
504 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0539899  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3796  L-ornithine N5-oxygenase  28.15 
 
 
444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902122  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02550  lysine/ornithine N-monooxygenase  29.31 
 
 
455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324873  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1163  lysine/ornithine N-monooxygenase  26.71 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1643  lysine/ornithine N-monooxygenase  26.71 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0478364  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1595  lysine/ornithine N-monooxygenase  25.71 
 
 
454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0832377  hitchhiker  0.00131609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5949  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  26.33 
 
 
463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4206  L-ornithine 5-monooxygenase oxidoreductase protein  28.72 
 
 
451 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4036  lysine/ornithine N-monooxygenase  28.21 
 
 
462 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3723  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  25.41 
 
 
452 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3622  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  25.94 
 
 
445 aa  144  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6165  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  28.31 
 
 
434 aa  143  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573981 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>