40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06749 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06749  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000840  hypothetical protein  86.5 
 
 		 179 aa  300  5.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0119  hypothetical protein  71.78 
 
 		 174 aa  250  8.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  47.5 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2809  lysozyme  49.3 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.836071  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  45.34 
 
 		 170 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  46.25 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  46.88 
 
 		 171 aa  143  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  45.34 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  45.34 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  45.62 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  45 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  47.18 
 
 		 171 aa  137  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2151  periplasmic protein-like protein  44.37 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.398152  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3028  periplasmic protein-like  41.67 
 
 		 192 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.348449  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  37.16 
 
 		 509 aa  105  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0986  hypothetical protein  38.93 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1075  hypothetical protein  35.03 
 
 		 170 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5056  hypothetical protein  34.12 
 
 		 175 aa  95.1  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3729  hypothetical protein  34.71 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12390  hypothetical protein  33.11 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5214  hypothetical protein  32.73 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0425  hypothetical protein  36.07 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5639  hypothetical protein  33.78 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0039  periplasmic protein  33.33 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1711  hypothetical protein  36.62 
 
 		 175 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.560041  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1640  hypothetical protein  35.92 
 
 		 175 aa  87  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.807151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0429  periplasmic-like protein  32.45 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135823  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3989  hypothetical protein  32.89 
 
 		 176 aa  84  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.587131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3634  hypothetical protein  31.87 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2814  hypothetical protein  30.56 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1856  hypothetical protein  32.41 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0845  hypothetical protein  30.09 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0853692  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0525  hypothetical protein  30 
 
 		 177 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000185554  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  41.18 
 
 		 233 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0212  hypothetical protein  29.07 
 
 		 156 aa  42  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0232  hypothetical protein  29.07 
 
 		 156 aa  42  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.691436  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  28.85 
 
 		 293 aa  41.6  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  38.1 
 
 		 229 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  31.17 
 
 		 229 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>