175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03002 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  99.65 
 
 
306 aa  592  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  99.65 
 
 
306 aa  592  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  99.65 
 
 
306 aa  592  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  99.3 
 
 
306 aa  590  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  99.3 
 
 
306 aa  589  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  98.95 
 
 
306 aa  587  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  98.95 
 
 
306 aa  587  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  98.95 
 
 
306 aa  588  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  97.89 
 
 
306 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  97.19 
 
 
306 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  97.19 
 
 
306 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  97.19 
 
 
306 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  94.41 
 
 
306 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  94.41 
 
 
306 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  93.68 
 
 
306 aa  559  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  98.9 
 
 
282 aa  558  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  91.96 
 
 
306 aa  556  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  91.96 
 
 
306 aa  556  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  91.32 
 
 
302 aa  550  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  92.28 
 
 
306 aa  551  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  91.61 
 
 
300 aa  552  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  79.79 
 
 
307 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  79.79 
 
 
307 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  79.79 
 
 
307 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  79.79 
 
 
307 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  79.79 
 
 
307 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  79.79 
 
 
307 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  79.79 
 
 
307 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  79.79 
 
 
307 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  79.79 
 
 
307 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  80.14 
 
 
307 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  79.44 
 
 
307 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  79.09 
 
 
307 aa  487  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  79.44 
 
 
307 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  79.44 
 
 
307 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  78.75 
 
 
307 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  78.75 
 
 
307 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  79.09 
 
 
307 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  79.09 
 
 
307 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  79.09 
 
 
307 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  79.09 
 
 
307 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  79.09 
 
 
307 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  78.4 
 
 
307 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  78.05 
 
 
307 aa  481  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  77.19 
 
 
307 aa  471  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  77.73 
 
 
262 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  97.93 
 
 
220 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  61.75 
 
 
307 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  61.75 
 
 
307 aa  368  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  58.45 
 
 
305 aa  348  8e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  56.49 
 
 
305 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  80.98 
 
 
198 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  56.49 
 
 
320 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  78.95 
 
 
171 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  58.22 
 
 
245 aa  278  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  57.28 
 
 
226 aa  250  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  44.48 
 
 
356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  88.19 
 
 
176 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  88.19 
 
 
176 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  96.43 
 
 
132 aa  229  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  96.43 
 
 
132 aa  229  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  42.61 
 
 
319 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  42.61 
 
 
319 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  42.96 
 
 
319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  41.88 
 
 
301 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  40 
 
 
310 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05983  hypothetical protein  98.97 
 
 
100 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  44.44 
 
 
304 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06919  hypothetical protein  77.24 
 
 
126 aa  201  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  77.31 
 
 
143 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  38.36 
 
 
322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  74.07 
 
 
128 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0610  transposase, IS4 family protein  72.97 
 
 
111 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  34.23 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  54.41 
 
 
167 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1661  transposase, IS4 family protein  51.52 
 
 
132 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3109  putative transposase  60.5 
 
 
145 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000406052 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0343  transposase  86.11 
 
 
72 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0196  transposase, IS4 family protein  29.7 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.658877  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0343  transposase, IS4 family protein  29.7 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.516118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0519  transposase, IS4 family protein  29.7 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0652  transposase, IS4 family protein  29.7 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.730193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0860  transposase, IS4 family protein  29.7 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0969  transposase, IS4 family protein  29.7 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1023  transposase, IS4 family protein  29.7 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1184  transposase, IS4 family protein  29.7 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0697073  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1595  transposase, IS4 family protein  29.7 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.51205  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05900  hypothetical protein  95.83 
 
 
56 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00549  hypothetical protein  95.83 
 
 
56 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7120  transposase  44.79 
 
 
108 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3008  putative transposase  42.72 
 
 
119 aa  89.7  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0625  transposase, IS4 family protein  53.33 
 
 
113 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3139  hypothetical protein  39.06 
 
 
128 aa  86.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6088  hypothetical protein  39.62 
 
 
176 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229843  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6001  hypothetical protein  37.1 
 
 
150 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05652  hypothetical protein  92.68 
 
 
43 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0991  hypothetical protein  39.18 
 
 
126 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.193632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4561  hypothetical protein  39.29 
 
 
113 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.546731  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7117  transposase  32.92 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>