32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001841 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  37.62 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  36.97 
 
 		 206 aa  132  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  36.04 
 
 		 199 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  36.54 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  36.89 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  37.62 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  35.61 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  37.73 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  37.9 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  37.11 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  37.38 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0768  hypothetical protein  34.98 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  35.98 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  34.95 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  34.47 
 
 		 189 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  34.31 
 
 		 189 aa  104  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  33.17 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  29.63 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  34.3 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  32.86 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  33.79 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3198  hypothetical protein  34.42 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4793  hypothetical protein  33.77 
 
 		 243 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3395  hypothetical protein  33.12 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4689  hypothetical protein  33.12 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2018  hypothetical protein  30.84 
 
 		 274 aa  58.2  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  36.08 
 
 		 360 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  30.39 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1404  hypothetical protein  40.35 
 
 		 72 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3782  hypothetical protein  30.77 
 
 		 272 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4260  hypothetical protein  31.13 
 
 		 239 aa  42  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>