19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001627 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001627  putative lipoprotein  100 
 
 		 349 aa  717    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0400  putative lipoprotein  39.43 
 
 		 340 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0707087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0873  putative lipoprotein  39.6 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.558011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0908  putative lipoprotein  39.6 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.208396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3409  putative lipoprotein  38.14 
 
 		 343 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3064  putative lipoprotein  39.02 
 
 		 335 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0230336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2963  putative lipoprotein  38.42 
 
 		 358 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.881094  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000609  putative lipoprotein  34.54 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000703703  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0449  putative lipoprotein  37.39 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  30.16 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2168  hypothetical protein  27.61 
 
 		 332 aa  86.3  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3086  hypothetical protein  24.63 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3610  hypothetical protein  25.16 
 
 		 328 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0231104  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  26.88 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1948  hypothetical protein  26.39 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0345461  normal  0.211381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2028  hypothetical protein  26.39 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal  0.315277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2599  hypothetical protein  25.3 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00476965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  26.11 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0938  putative lipoprotein  27.08 
 
 		 321 aa  50.4  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>