236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001055 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001055  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  100 
 
 
214 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.829142  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1959  methyltransferase type 12  49.24 
 
 
204 aa  198  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  40.8 
 
 
208 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  36.92 
 
 
194 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 
194 aa  104  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
253 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  40 
 
 
253 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  37.63 
 
 
253 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 
253 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  41.57 
 
 
251 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  35.79 
 
 
262 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
268 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  38.64 
 
 
305 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  40.45 
 
 
251 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  26.29 
 
 
263 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.92 
 
 
247 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0438785  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  37.89 
 
 
262 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  34.69 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  34 
 
 
255 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  37.23 
 
 
257 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.89 
 
 
232 aa  52.4  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.89 
 
 
232 aa  52.4  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.68 
 
 
242 aa  52.4  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.67 
 
 
239 aa  52  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1261  Methyltransferase type 12  35.96 
 
 
254 aa  52  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00506996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25 
 
 
240 aa  52  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  28.95 
 
 
294 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
262 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1501  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.75 
 
 
235 aa  51.6  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209044  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.73 
 
 
247 aa  51.6  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1825  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.75 
 
 
235 aa  51.6  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.26 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.26 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4680  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
260 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.14 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.18 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3894  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
257 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.69 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  28.39 
 
 
265 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.78 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.7 
 
 
233 aa  50.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 
332 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
265 aa  49.7  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.12 
 
 
244 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.38 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.16 
 
 
245 aa  49.3  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.04 
 
 
258 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.43 
 
 
232 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.88 
 
 
243 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  26.35 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.81 
 
 
252 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  33.66 
 
 
248 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  26.51 
 
 
287 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  24.35 
 
 
330 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  28.97 
 
 
241 aa  48.9  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.17 
 
 
262 aa  49.3  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.88 
 
 
234 aa  48.9  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.23 
 
 
259 aa  48.9  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.43 
 
 
258 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0736  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
232 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421351  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0575  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.3 
 
 
245 aa  48.1  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  29.67 
 
 
267 aa  48.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  25.17 
 
 
400 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.63 
 
 
310 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.11 
 
 
240 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1672  Methyltransferase type 12  28.23 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  34.83 
 
 
414 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  27.27 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.22 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  30 
 
 
270 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.52 
 
 
236 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.41 
 
 
232 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.97 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.31 
 
 
247 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  35.51 
 
 
261 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  28.72 
 
 
264 aa  46.6  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  25.81 
 
 
244 aa  46.6  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.07 
 
 
242 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.07 
 
 
242 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  24.06 
 
 
311 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.47 
 
 
238 aa  46.6  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.26 
 
 
248 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.07 
 
 
242 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.71 
 
 
231 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  25.61 
 
 
354 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.07 
 
 
242 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
225 aa  46.2  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.07 
 
 
242 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.12 
 
 
276 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.36 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0439  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.93 
 
 
229 aa  46.2  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
247 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
266 aa  46.2  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>