129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000633 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000633  succinate dehydrogenase subunit  100 
 
 
335 aa  694    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2731  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  65.85 
 
 
338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291294  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3861  ectoine utilization protein EutE  59.28 
 
 
345 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4423  hypothetical protein  58.66 
 
 
331 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112678 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5802  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  58.13 
 
 
342 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98283  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6166  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  58.13 
 
 
342 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6142  ectoine utilization protein EutE  57.44 
 
 
346 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6647  ectoine utilization protein EutE  57.83 
 
 
342 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0058  hypothetical protein  56.76 
 
 
349 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.630853  hitchhiker  0.00778397 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6021  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  57.1 
 
 
341 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5777  ectoine utilization protein EutE  57.1 
 
 
341 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0434759  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4379  ectoine utilization protein EutE  58.02 
 
 
333 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5243  ectoine utilization protein EutE  56.71 
 
 
335 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.472707 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3692  ectoine utilization protein EutE  55.49 
 
 
334 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2148  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  55.42 
 
 
343 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5522  ectoine utilization protein EutE  56.71 
 
 
335 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516127 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2694  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  54.74 
 
 
330 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.620459  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3466  ectoine utilization protein EutE  56.66 
 
 
342 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681288  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3178  hypothetical protein  55.15 
 
 
335 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.860392  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0288  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  54.85 
 
 
333 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0849  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  44.24 
 
 
330 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.470492  normal  0.0879559 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5425  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.66 
 
 
337 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862151  normal  0.958012 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4154  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.75 
 
 
346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3886  succinylglutamatedesuccinylase/aspartoacylase  36.45 
 
 
346 aa  228  8e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3854  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.87 
 
 
334 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6127  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  37.2 
 
 
346 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.9972  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4430  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  37.46 
 
 
338 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7499  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.53 
 
 
344 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0759996  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1693  hypothetical protein  36.45 
 
 
340 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603586  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1677  hypothetical protein  36.45 
 
 
340 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0557  hypothetical protein  36.45 
 
 
340 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.961363  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1885  hypothetical protein  36.45 
 
 
343 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2412  hypothetical protein  36.45 
 
 
412 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2273  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  36.45 
 
 
403 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119116  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0742  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  36.45 
 
 
494 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1538  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.55 
 
 
346 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3856  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.24 
 
 
357 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.404909  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5881  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.55 
 
 
344 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3941  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.55 
 
 
344 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4425  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.55 
 
 
344 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4317  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.94 
 
 
346 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.925713 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4196  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.35 
 
 
344 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399198  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2100  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.28 
 
 
333 aa  192  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66463  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0386  hypothetical protein  37.46 
 
 
332 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7662  putative succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.62 
 
 
348 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6377  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.52 
 
 
337 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0823471  normal  0.671945 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0705  hypothetical protein  42.11 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  32.09 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2778  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.88 
 
 
346 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000135015  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004275  predicted deacylase  27.7 
 
 
355 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.29 
 
 
350 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00715  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.28 
 
 
343 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4403  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.16 
 
 
350 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453747  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.77 
 
 
341 aa  99.4  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01154  hypothetical protein  28.04 
 
 
356 aa  99.8  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0759  hypothetical protein  26.71 
 
 
364 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0635712  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3665  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.74 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1872  hypothetical protein  29.53 
 
 
362 aa  95.9  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  29.02 
 
 
334 aa  95.9  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2062  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.03 
 
 
354 aa  93.2  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221832  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1362  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.33 
 
 
349 aa  92.8  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000119521 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3168  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.21 
 
 
319 aa  90.5  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0840  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.1 
 
 
318 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.678426  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.52 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1767  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.8 
 
 
356 aa  85.9  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1548  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.48 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3803  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.57 
 
 
481 aa  83.6  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1583  hypothetical protein  25.95 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2097  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.64 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.150498  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0279  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.89 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2858  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.39 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.211613 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.3 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1385  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.3 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2953  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.3 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.124996  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2690  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.64 
 
 
337 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2758  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.64 
 
 
337 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1426  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.34 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0161  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  39.45 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0204  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.13 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1092  hypothetical protein  28.3 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.411862 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0725  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.83 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.330277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1424  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.95 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0298  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.09 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0428528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4117  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.27 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.799138 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2639  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.75 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1312  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.04 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0100  deacylase-like  38.89 
 
 
510 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1213  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.85 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204806  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3134  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.2 
 
 
314 aa  77  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100707  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1255  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.86 
 
 
318 aa  77  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2075  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.49 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.763346  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23200  predicted deacylase  22.25 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3124  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.24 
 
 
385 aa  75.9  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  26.73 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1425  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.99 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  26.73 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0260  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.96 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1973  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.14 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0907521 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0243  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.62 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00932819  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000043  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.82 
 
 
331 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>