27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2199 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2199  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3668  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.46 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0352  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.8 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0358  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.95 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4168  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4035  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.14 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3285  putative amino acid ABC transporter  26.34 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1240  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4353  hypothetical protein  33.98 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2740  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.29 
 
 		 1016 aa  53.1  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  25.56 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0286  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4222  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0872953 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4000  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  20.97 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1910  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.93 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0380327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  30.43 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  30 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  20.22 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  23.74 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3412  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1070  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  22.22 
 
 		 264 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1026  amino acid ABC transporter  21.52 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>