More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1010 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1010  chemotaxis protein CheY  100 
 
 		 124 aa  253  6e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03243  chemotaxis protein CheY  54.17 
 
 		 125 aa  134  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4608  response regulator receiver domain-containing protein  43.44 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 122 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2326  response regulator receiver domain-containing protein  43.22 
 
 		 132 aa  110  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0765  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 130 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474534  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1850  response regulator receiver protein  51.69 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  39.84 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2050  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000730652 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  39.34 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 120 aa  100  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  39.5 
 
 		 121 aa  100  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 124 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  38.02 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2312  response regulator receiver domain-containing protein  42.24 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  39.67 
 
 		 121 aa  98.2  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 120 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  41.32 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 120 aa  95.9  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 1758 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  38.84 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0235  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3147  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  93.6  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  40.5 
 
 		 770 aa  93.6  9e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  40 
 
 		 120 aa  93.6  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  38.52 
 
 		 769 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  38.84 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  38.52 
 
 		 769 aa  92.8  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  38.52 
 
 		 769 aa  92.8  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  39.13 
 
 		 770 aa  93.2  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  37.5 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  37.5 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  40.35 
 
 		 774 aa  92  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 		 1907 aa  92  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  41.03 
 
 		 1989 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 121 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  39.66 
 
 		 116 aa  90.9  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  35.83 
 
 		 120 aa  90.9  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 128 aa  90.5  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0739  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0754  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  90.1  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  40.16 
 
 		 1956 aa  90.1  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  38.39 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  38.33 
 
 		 123 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  41.96 
 
 		 1866 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  39.13 
 
 		 783 aa  89.7  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1263  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  42.45 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 808 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2367  CheA signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 688 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.990508  decreased coverage  0.0000928264 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  34.17 
 
 		 120 aa  89.4  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 121 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  37.19 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  34.71 
 
 		 764 aa  89  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 2009 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  38.33 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>