More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0790 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



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Replicon accession
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Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0790  proton/glutamate symporter  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000536716  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  83.7 
 
 		 419 aa  313  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  80.43 
 
 		 419 aa  300  8.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  75.56 
 
 		 417 aa  276  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  57.22 
 
 		 408 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  56.35 
 
 		 408 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  58.99 
 
 		 420 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  58.79 
 
 		 416 aa  195  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  58.24 
 
 		 416 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  58.24 
 
 		 416 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  58.24 
 
 		 416 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  58.24 
 
 		 412 aa  192  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  57.69 
 
 		 416 aa  192  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  57.69 
 
 		 409 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  57.69 
 
 		 409 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  57.14 
 
 		 409 aa  192  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  59.12 
 
 		 408 aa  191  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  31 
 
 		 438 aa  115  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  31 
 
 		 438 aa  114  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  32.97 
 
 		 443 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  33.16 
 
 		 444 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  33.16 
 
 		 444 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  32.98 
 
 		 442 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0155  glutamate/aspartate:proton symporter  32.98 
 
 		 442 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0153  glutamate/aspartate:proton symporter  32.98 
 
 		 442 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  32.09 
 
 		 443 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  30.46 
 
 		 436 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  30.46 
 
 		 436 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  30.46 
 
 		 436 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  30.46 
 
 		 436 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  30.46 
 
 		 436 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  32.09 
 
 		 443 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  37.65 
 
 		 423 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  32.45 
 
 		 443 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  31.75 
 
 		 438 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  37.65 
 
 		 423 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  29.95 
 
 		 437 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  29.95 
 
 		 437 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  29.95 
 
 		 437 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  37.65 
 
 		 423 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  29.95 
 
 		 437 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  29.95 
 
 		 437 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3920  glutamate/aspartate:proton symporter  31.91 
 
 		 438 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3946  glutamate/aspartate:proton symporter  31.91 
 
 		 438 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  37.06 
 
 		 423 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3834  glutamate/aspartate:proton symporter  31.91 
 
 		 438 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.918484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  29.95 
 
 		 437 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  29.95 
 
 		 437 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  29.95 
 
 		 437 aa  108  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  29.95 
 
 		 437 aa  108  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5090  glutamate/aspartate:proton symporter  31.91 
 
 		 442 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1855  sodium:dicarboxylate symporter  33.15 
 
 		 414 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  37.06 
 
 		 423 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  37.06 
 
 		 423 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  37.06 
 
 		 423 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  37.06 
 
 		 423 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  37.06 
 
 		 423 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  37.42 
 
 		 409 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  36.36 
 
 		 402 aa  105  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2704  sodium:dicarboxylate symporter  32.89 
 
 		 438 aa  104  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  32.39 
 
 		 433 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  32.56 
 
 		 409 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0277  glutamate/aspartate:proton symporter  31.68 
 
 		 437 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  31.82 
 
 		 424 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  38.31 
 
 		 433 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  32.95 
 
 		 432 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  31.82 
 
 		 440 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  34.87 
 
 		 440 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  31.82 
 
 		 435 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  39.69 
 
 		 445 aa  102  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  41.48 
 
 		 434 aa  101  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  41.48 
 
 		 434 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3697  C4-dicarboxylate transporter DctA  29.21 
 
 		 420 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0331766  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  31.25 
 
 		 443 aa  99.8  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3346  C4-dicarboxylate transporter DctA  30 
 
 		 438 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00211585  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  31.82 
 
 		 444 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  31.82 
 
 		 444 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  31.82 
 
 		 444 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6468  sodium:dicarboxylate symporter  30.73 
 
 		 442 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955844  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  34.12 
 
 		 422 aa  99  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  34.21 
 
 		 444 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3597  C4-dicarboxylate transporter DctA  29.21 
 
 		 420 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021811 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3294  C4-dicarboxylate transporter DctA  29.21 
 
 		 420 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0209332  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5604  sodium:dicarboxylate symporter  31.25 
 
 		 442 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5968  sodium:dicarboxylate symporter  31.25 
 
 		 442 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431964  hitchhiker  0.00472549 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3380  C4-dicarboxylate transporter DctA  29.21 
 
 		 420 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1620  C4-dicarboxylate transporter DctA  29.55 
 
 		 420 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000559641  hitchhiker  0.000636022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  31.25 
 
 		 430 aa  97.8  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6252  sodium:dicarboxylate symporter  31.25 
 
 		 442 aa  97.8  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1976  proton/sodium-glutamate symport protein  34.27 
 
 		 426 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.809578  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2455  sodium:dicarboxylate symporter  37.33 
 
 		 425 aa  97.1  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2408  sodium:dicarboxylate symporter  37.33 
 
 		 425 aa  97.1  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.557751  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2416  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 		 438 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  38.31 
 
 		 434 aa  97.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  32.61 
 
 		 439 aa  96.7  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  33.55 
 
 		 449 aa  96.7  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  31.72 
 
 		 439 aa  95.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  37.25 
 
 		 417 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  32.57 
 
 		 413 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_2244  C4-dicarboxylate transporter DctA  28.09 
 
 		 413 aa  94.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0602805  n/a   
 
 
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