43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0245 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  73.21 
 
 		 209 aa  324  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  63.94 
 
 		 209 aa  287  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  32.06 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  29.38 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  29.38 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  29.38 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  29.38 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  29.38 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  29.38 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  29.38 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  29.38 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  29.38 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  29.38 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  29.38 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  28.91 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  28.91 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  28.91 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1106  glutaredoxin 2  28.44 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  27.44 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  28.57 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3221  glutaredoxin 2  27.91 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  28.44 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  29.86 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  28.44 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1801  glutaredoxin 2  29.82 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1961  glutaredoxin 2  29.03 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  28.31 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3458  GrxB family glutaredoxin  30.65 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142149  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38124  predicted protein  34.88 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  39.44 
 
 		 77 aa  45.4  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  41.33 
 
 		 118 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  41.33 
 
 		 118 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2771  Glutathione S-transferase domain protein  30.84 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  38.67 
 
 		 118 aa  42.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  38.67 
 
 		 118 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  38.67 
 
 		 118 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  38.67 
 
 		 118 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  38.67 
 
 		 118 aa  42  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  38.67 
 
 		 118 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  38.67 
 
 		 118 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06861  glutathione S-transferase N terminus  32.39 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  38.67 
 
 		 118 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>