39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1396 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1396  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  329  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2743  hypothetical protein  28.21 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0788  hypothetical protein  34.78 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.449202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3184  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0964  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 281 aa  57.4  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  43.75 
 
 		 292 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  54.05 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  48.84 
 
 		 315 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  55.26 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3881  hypothetical protein  30.06 
 
 		 285 aa  54.3  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  48.89 
 
 		 306 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  51.35 
 
 		 286 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0023  Rhomboid family protein  41.67 
 
 		 278 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.816086  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  51.35 
 
 		 282 aa  51.2  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  45.45 
 
 		 303 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  40.48 
 
 		 293 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0295  Rhomboid family protein  30.38 
 
 		 317 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  42.86 
 
 		 292 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0004  hypothetical protein  32.17 
 
 		 287 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.971077  hitchhiker  0.000830744 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  48.65 
 
 		 305 aa  48.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  39.53 
 
 		 298 aa  48.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  48.65 
 
 		 275 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  36.51 
 
 		 289 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  36.51 
 
 		 289 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  36.51 
 
 		 289 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  48.65 
 
 		 381 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 287 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  38.3 
 
 		 306 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  39.58 
 
 		 284 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  42.5 
 
 		 291 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  40.48 
 
 		 290 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  40.48 
 
 		 279 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  43.24 
 
 		 286 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  35 
 
 		 292 aa  43.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  43.24 
 
 		 356 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  29.87 
 
 		 303 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  37.78 
 
 		 303 aa  42  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  43.18 
 
 		 298 aa  41.2  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  37.21 
 
 		 336 aa  40.8  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>