More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0721 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
243 aa  467  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.06 
 
 
243 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.48 
 
 
241 aa  260  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.397632  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.56 
 
 
244 aa  247  1e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00218262  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 
248 aa  205  7e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0340  putative sulfonate transport system permease protein  45.23 
 
 
248 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
251 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0856  ABC-type transport system, permease component  27.75 
 
 
245 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.376745  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.16 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0566341  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.38 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.38 
 
 
250 aa  92  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0273094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.94 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1347  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.15 
 
 
260 aa  90.5  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000648082  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.83 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0565837  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.25 
 
 
263 aa  89  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03220  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  29.41 
 
 
394 aa  89  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2358  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  25.75 
 
 
269 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.540869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  26.46 
 
 
272 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.62 
 
 
258 aa  85.9  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.27 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  25.45 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.35 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.231998 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0211  ABC transporter permease  27.19 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000181791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.71 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.4 
 
 
532 aa  82.4  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.85 
 
 
279 aa  82  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.09 
 
 
536 aa  82  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  27.07 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0426  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.93 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  27.81 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.98 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498901  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.12 
 
 
283 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.31 
 
 
280 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.97 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000228451  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.58 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.983442  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  26.38 
 
 
277 aa  77  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.27 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.93 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1737  ABC transporter, permease protein  22.75 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0444419  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.03 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.15 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25857  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.91 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.57 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.57 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.96 
 
 
284 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.37 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0678072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.97 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.27 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.35 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  26.69 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  25.45 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.05 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.29 
 
 
537 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.300396  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0423  abcb protein  26.36 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  26.24 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  26.24 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  26.27 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.87 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.73 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  24.32 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.4 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.4 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.45 
 
 
285 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.83 
 
 
278 aa  72  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.4 
 
 
200 aa  72  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.711795  normal  0.191402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.84 
 
 
277 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4842  putative ABC transporter (permease protein)  28.96 
 
 
286 aa  72  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.15 
 
 
253 aa  72  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.957931  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001608  nitrate ABC transporter permease protein  25.71 
 
 
321 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  23.43 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  23.43 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  23.85 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0210  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  22.43 
 
 
532 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  23.85 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.31 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  23.43 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  23.85 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1465  ABC transporter permease  22.51 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05589  hypothetical protein  25.31 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.46 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.04 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.55 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.55 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.16 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.82 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2919  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  26.89 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.35916e-18 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.09 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.58 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  23.18 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.22 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0448966  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.46 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.703431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  25.35 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.85 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08100  ABC transporter, permease component  24.45 
 
 
528 aa  69.7  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7197  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  27.07 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0116141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>