46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1542 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1542  paREP7  100 
 
 
317 aa  590  1e-167  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.380993  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0989  hypothetical protein  59.44 
 
 
336 aa  247  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.132758  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1907  paREP7  36.01 
 
 
303 aa  172  5e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000000796589  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0605  hypothetical protein  41.74 
 
 
353 aa  151  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0222  hypothetical protein  41.26 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1757  hypothetical protein  38.87 
 
 
305 aa  143  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0327  paREP7  31.91 
 
 
253 aa  103  5e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0185  paREP7  31.58 
 
 
253 aa  102  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  0.966821 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0492  hypothetical protein  34.78 
 
 
229 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.821112 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1685  hypothetical protein  30.69 
 
 
386 aa  82.4  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000183285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2227  hypothetical protein  43.86 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3277  hypothetical protein  33.11 
 
 
217 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000129016  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1375  hypothetical protein  37.96 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2318  Protein of unknown function DUF1626  28.15 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0252538 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1548  hypothetical protein  29.57 
 
 
219 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3269  low complexity protein, contains internal repeats QQVlQQDVAQLQAG  26.17 
 
 
198 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3381  hypothetical protein  29.68 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1392  2 domain protein  27.8 
 
 
252 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1426  hypothetical protein  27.8 
 
 
252 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0460  hypothetical protein  35.71 
 
 
212 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0991  hypothetical protein  28.85 
 
 
241 aa  52  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.95618  normal  0.04449 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0574  hypothetical protein  34.09 
 
 
209 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  36.67 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1695  paREP7  36.84 
 
 
226 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2036  hypothetical protein  42.86 
 
 
244 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1276  hypothetical protein  42.86 
 
 
244 aa  50.1  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.160585 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0621  hypothetical protein  32.99 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149956  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  25.86 
 
 
823 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0534  hypothetical protein  31.97 
 
 
357 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2328  hypothetical protein  26.18 
 
 
256 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.698031  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1496  chromosome segregation ATPase-like protein  26.26 
 
 
985 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0412126  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1156  hypothetical protein  36.36 
 
 
149 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874772 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0373  hypothetical protein  28.3 
 
 
318 aa  46.6  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1898  hypothetical protein  28.33 
 
 
284 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0285  hypothetical protein  34.44 
 
 
193 aa  46.2  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000769793  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1705  hypothetical protein  27.24 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.594083  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0076  hypothetical protein  25.89 
 
 
133 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000188412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  25.73 
 
 
1132 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  28.49 
 
 
1132 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  23.61 
 
 
915 aa  43.5  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1343  chromosome segregation ATPases-like  30.26 
 
 
321 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0820  hypothetical protein  22.07 
 
 
863 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02530  hypothetical protein  27.11 
 
 
1353 aa  43.5  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1150  hypothetical protein  36.36 
 
 
254 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal  0.0462883 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.77 
 
 
769 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0419  hypothetical protein  29.13 
 
 
270 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>