18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0373 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0373  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  617  1e-176  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1661  hypothetical protein  29.48 
 
 
350 aa  99.8  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.311984  decreased coverage  0.00222329 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1982  hypothetical protein  29.48 
 
 
329 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.411826  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0590  hypothetical protein  28.48 
 
 
329 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0688  hypothetical protein  27.36 
 
 
329 aa  87  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1357  putative phosphoserine phosphatase  23.97 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00112644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1731  hypothetical protein  28.98 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0794939  normal  0.739423 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1923  conserved hypothetical protein  24.82 
 
 
298 aa  57  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.547441  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0141  hypothetical protein  25.58 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00753  nuclear segregation protein (Bfr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14120)  27.27 
 
 
484 aa  52.8  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.119324  normal  0.769842 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1450  putative phosphoserine phosphatase  25.41 
 
 
286 aa  49.7  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1542  paREP7  28.3 
 
 
317 aa  46.6  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.380993  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2705  hypothetical protein  24.34 
 
 
296 aa  46.2  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.878489  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0293  putative phosphoserine phosphatase  27.27 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202357  normal  0.275422 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  26.32 
 
 
1535 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1000  hypothetical protein  34.78 
 
 
342 aa  43.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0177327  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0943  putative phosphoserine phosphatase  24 
 
 
286 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.458027  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0936  phosphoserine phosphatase  24.17 
 
 
285 aa  42.7  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>