143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4127 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  61.54 
 
 		 540 aa  650    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  100 
 
 		 532 aa  1080    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  91.79 
 
 		 437 aa  753    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  91.17 
 
 		 531 aa  988    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  36.39 
 
 		 524 aa  222  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  34.42 
 
 		 490 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  34.13 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  39.43 
 
 		 451 aa  217  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  39.2 
 
 		 499 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  34.8 
 
 		 492 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  36.7 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  34.8 
 
 		 492 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  36.7 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  34.65 
 
 		 473 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  34.65 
 
 		 473 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  35.78 
 
 		 473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  35.14 
 
 		 446 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  35.14 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  35.14 
 
 		 492 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  36.97 
 
 		 489 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  34.27 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  35.53 
 
 		 442 aa  211  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  35.53 
 
 		 442 aa  211  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  35.9 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2474  hypothetical protein  83.48 
 
 		 115 aa  208  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  36.02 
 
 		 519 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  38.93 
 
 		 454 aa  208  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  35.37 
 
 		 444 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  35.7 
 
 		 507 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  35.7 
 
 		 507 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  35.7 
 
 		 507 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  35.7 
 
 		 507 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  35.02 
 
 		 519 aa  207  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  35.41 
 
 		 552 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  34.36 
 
 		 507 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  34.36 
 
 		 507 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  34.84 
 
 		 447 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  36.65 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  33.26 
 
 		 593 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  34.54 
 
 		 551 aa  200  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  32.72 
 
 		 495 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  33.41 
 
 		 510 aa  195  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  35.4 
 
 		 508 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  35.15 
 
 		 508 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  31.75 
 
 		 518 aa  191  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  31.47 
 
 		 513 aa  190  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  35.98 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  33.92 
 
 		 501 aa  187  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  34.16 
 
 		 511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  31.87 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  32.61 
 
 		 497 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  32.53 
 
 		 534 aa  170  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  32.27 
 
 		 533 aa  170  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  41.8 
 
 		 317 aa  169  9e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  36.17 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  44.92 
 
 		 240 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  44.92 
 
 		 239 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  33.73 
 
 		 387 aa  126  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  32.6 
 
 		 572 aa  94  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  26.29 
 
 		 432 aa  93.6  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  25.77 
 
 		 442 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  28.71 
 
 		 627 aa  92.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  26.97 
 
 		 546 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  28.21 
 
 		 408 aa  88.2  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  26.91 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  26.2 
 
 		 561 aa  81.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  28.1 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  32.43 
 
 		 661 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  25.84 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  24.92 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  35.33 
 
 		 469 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  27.66 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  30.95 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  41.84 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  30.14 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  30 
 
 		 391 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 494 aa  66.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  39.8 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  26.35 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  26.22 
 
 		 577 aa  63.5  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  24.85 
 
 		 526 aa  62.4  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  25.56 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10096  hypothetical protein  41.18 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.493023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  43.21 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  25.71 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  26.27 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  26.27 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  25.43 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  25.56 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  26.2 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  39.58 
 
 		 504 aa  56.2  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  32.14 
 
 		 434 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  33.93 
 
 		 445 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  32.14 
 
 		 430 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  33.93 
 
 		 445 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  34.82 
 
 		 426 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  34.82 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4658  hypothetical protein  26.9 
 
 		 275 aa  55.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  29.46 
 
 		 538 aa  53.5  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  34.38 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>