More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3826 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3826  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 260 aa  524  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3981  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  78.09 
 
 		 257 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13583  enoyl-CoA hydratase  72.31 
 
 		 247 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5266  enoyl-CoA hydratase  69.92 
 
 		 251 aa  351  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1490  enoyl-CoA hydratase  70.33 
 
 		 251 aa  350  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5068  enoyl-CoA hydratase  68.7 
 
 		 252 aa  348  6e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4683  enoyl-CoA hydratase  68.7 
 
 		 252 aa  348  6e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4769  enoyl-CoA hydratase  68.7 
 
 		 252 aa  348  6e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0532353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4618  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.61 
 
 		 263 aa  331  7.000000000000001e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2352  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.32 
 
 		 253 aa  331  7.000000000000001e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0605839  normal  0.0748288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2743  enoyl-CoA hydratase  71.09 
 
 		 259 aa  321  8e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2065  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.26 
 
 		 255 aa  320  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1381  enoyl-CoA hydratase  68.78 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2803  enoyl-CoA hydratase  59.49 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72856  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2604  enoyl-CoA hydratase  60.78 
 
 		 271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.888828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2158  enoyl-CoA hydratase  48.72 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1562  enoyl-CoA hydratase  47.44 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3755  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.64 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1436  enoyl-CoA hydratase  46.61 
 
 		 269 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3627  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.92 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.270403  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.14 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5498  enoyl-CoA hydratase  34.16 
 
 		 253 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1562  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5876  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 		 268 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1532  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.383816  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3752  enoyl-CoA hydratase  30.71 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.78 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6159  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.72 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.11 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2625  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.24 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  31.98 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.34 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.03 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.03 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.03 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.4 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.932872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3284  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.4 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.64 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.03 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  34.2 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  32.71 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  32.24 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  34.93 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.34 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  30.7 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  30.7 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.8 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  30.7 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.75 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  31.84 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2612  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.13 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40881  normal  0.0709716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.77 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  32.72 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.65 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  32.72 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  31.84 
 
 		 275 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  30.26 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  30.26 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.66 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  29.37 
 
 		 272 aa  98.6  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  31.02 
 
 		 275 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  31.46 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.75 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.72 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.88 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  29.77 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.38 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  29.77 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  29.77 
 
 		 297 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.77 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  29.77 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  29.77 
 
 		 297 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  29.77 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.55 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  35.12 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  29.17 
 
 		 262 aa  95.9  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.87 
 
 		 267 aa  95.5  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06235  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G03410)  32.97 
 
 		 240 aa  95.5  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0989568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  29.29 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.63 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  29.77 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  31.34 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.79 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.58 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  30.56 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  36.06 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>