37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2711 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  100 
 
 		 246 aa  479  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  53.47 
 
 		 245 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  53.06 
 
 		 245 aa  231  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  47.76 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  45.83 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  43.67 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  45.93 
 
 		 245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  45.78 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  46.28 
 
 		 245 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  46.28 
 
 		 245 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  46.28 
 
 		 245 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  43.51 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  43.67 
 
 		 245 aa  158  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  42.8 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  39.43 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  42.51 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  40.17 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  42.17 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  46.06 
 
 		 247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  39.45 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  38.46 
 
 		 253 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  40.87 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  38.15 
 
 		 247 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  43.72 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  37.13 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  36.71 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  38.11 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  38.79 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  36.44 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  35.1 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  33.61 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  29.05 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  28.63 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  24.45 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  25.31 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  25.45 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  22.67 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>