More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1024 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1024  Integrase catalytic region  100 
 
 		 430 aa  873    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.669349  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2579  Integrase catalytic region  57.04 
 
 		 428 aa  472  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1024  integrase catalytic region  54.13 
 
 		 408 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0461677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1968  integrase catalytic region  54.13 
 
 		 408 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3160  integrase catalytic region  54.13 
 
 		 408 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4926  integrase catalytic region  54.13 
 
 		 408 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409648  normal  0.357662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2854  integrase catalytic region  54.13 
 
 		 408 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1591  integrase catalytic region  54.13 
 
 		 408 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379475 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12957  transposase  51.95 
 
 		 413 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2580  integrase catalytic region  50.49 
 
 		 408 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0415627  normal  0.0862482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0482  integrase catalytic subunit  49.88 
 
 		 419 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3040  Integrase catalytic region  51.54 
 
 		 421 aa  383  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000772165  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3900  integrase catalytic subunit  48.27 
 
 		 405 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3601  Integrase catalytic region  49.13 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000351603  normal  0.0699896 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3701  Integrase catalytic region  49.13 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  0.162574 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25730  integrase family protein  50.3 
 
 		 333 aa  306  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2245  IS1533 transposase  55.33 
 
 		 264 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0270795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13668  transposase  46.43 
 
 		 166 aa  142  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0360997 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13667  transposase  58.88 
 
 		 115 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0362763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  30.39 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  30.39 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1063  Integrase catalytic region  30.39 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.877216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1072  Integrase catalytic region  30.39 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  30.39 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  30.39 
 
 		 502 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2939  Integrase catalytic region  30.39 
 
 		 502 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1589  Integrase catalytic region  30.13 
 
 		 502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0943  Integrase catalytic region  30.13 
 
 		 502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.346378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  28.98 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  28.98 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  28.98 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  28.98 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  28.98 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  28.98 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  28.98 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  28.98 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  28.98 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  28.64 
 
 		 449 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  28.64 
 
 		 449 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3159  transposase, IS21 family  30.03 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4040  hypothetical protein  30.03 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2090  transposase, IS21 family  30.03 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6478  Integrase catalytic region  30 
 
 		 507 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0317  transposase, IS21 family  30.03 
 
 		 496 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0223423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0010  transposase, IS21 family  29.76 
 
 		 496 aa  106  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2468  integrase catalytic subunit  30.15 
 
 		 514 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0578  integrase, catalytic region  41.01 
 
 		 145 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  28.5 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  28.5 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  28.5 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  25.88 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  25.88 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  25.88 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  25.59 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  28.61 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1097  Integrase catalytic region  28.39 
 
 		 474 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.81424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  27.61 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1530  integrase catalytic subunit  26.43 
 
 		 523 aa  95.5  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2334  integrase catalytic subunit  26.43 
 
 		 523 aa  95.5  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1139  Integrase catalytic region  28.12 
 
 		 474 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  27.94 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0624  transposase  29.24 
 
 		 610 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337489  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31560  Transposase  29.55 
 
 		 341 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 		 431 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4913  integrase catalytic subunit  26.88 
 
 		 428 aa  89  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279769 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0018  integrase catalytic region  27.36 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5653  integrase catalytic region  27.36 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2511  integrase catalytic region  27.36 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4737  integrase catalytic region  27.36 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09530  integrase  29.55 
 
 		 341 aa  87.8  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2295  integrase catalytic region  27.36 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6239  integrase catalytic region  27.36 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  24.67 
 
 		 434 aa  87  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  24.67 
 
 		 434 aa  87  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0786  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49630  helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.840005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36480  transposase, helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0046  ISGsu6, transposase OrfA  30.99 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2593  ISGsu6, transposase OrfA  30.99 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0321  integrase catalytic subunit  31.66 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0105931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1118  integrase catalytic subunit  31.66 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1789  integrase catalytic subunit  31.66 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2272  integrase catalytic subunit  31.66 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0220216  hitchhiker  0.000461104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2539  integrase catalytic subunit  31.66 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00047026  hitchhiker  0.00000000018385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2586  integrase catalytic subunit  31.66 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0248633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2797  integrase catalytic subunit  31.66 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3282  integrase catalytic subunit  31.66 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.590315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0199  Integrase catalytic region  26.1 
 
 		 512 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1326  Integrase catalytic region  26.88 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1512  Integrase catalytic region  26.58 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3693  Integrase catalytic region  26.58 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3280  transposase  28.68 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6529  Integrase catalytic region  26.1 
 
 		 512 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3058  Integrase catalytic region  26.58 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1791  putative transposase catalytic subunit  26.47 
 
 		 507 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  26.71 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2305  Integrase catalytic region  25.85 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0376  Integrase catalytic region  25.85 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  25.13 
 
 		 507 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  25.13 
 
 		 507 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>