More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0900 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0900  luciferase-like protein  100 
 
 
284 aa  558  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1652  Luciferase-like monooxygenase  50 
 
 
296 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0921038  normal  0.0160005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6389  luciferase family protein  39.93 
 
 
298 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3462  Luciferase-like, subgroup  38.14 
 
 
281 aa  142  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  37.13 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  33.22 
 
 
284 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2353  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.5 
 
 
287 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1583  luciferase family protein  35.21 
 
 
289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4790  luciferase-like protein  37.5 
 
 
284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5156  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.89 
 
 
203 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  35.06 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  34 
 
 
324 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  32.33 
 
 
309 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.55 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.42 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  37.58 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  38.51 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  28.5 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  37.43 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  33.85 
 
 
316 aa  77  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  31.82 
 
 
307 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  36.57 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  31.46 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  35.59 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  33.66 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  31.28 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  33.85 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  31.28 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  33.66 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  33.7 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1188  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  28.25 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  32.8 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  35.15 
 
 
557 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  31.05 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  33.5 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  34.81 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  29.78 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  35.63 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  29.77 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  30.7 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  34.9 
 
 
753 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  32.45 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.16 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3301  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  28.08 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  32.45 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  30.41 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  32.45 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  30.39 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  35.15 
 
 
543 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  31.89 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  30.3 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  35.12 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  30.34 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  26.16 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  33.68 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  26.16 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  26.16 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  33.62 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  25.59 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  29.05 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  34.87 
 
 
306 aa  68.9  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  32.69 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.54 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  40.57 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  33.51 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.32 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  31.79 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  32.98 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  31.63 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  31.79 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  36.78 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  31.79 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  28.23 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  30.92 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  30.26 
 
 
335 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  35.06 
 
 
316 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  35.29 
 
 
321 aa  67  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  31.58 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  37.59 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  34.29 
 
 
311 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  26.45 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  31.52 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  32.2 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
531 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  25 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  31.13 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  31.51 
 
 
360 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  32.49 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  30.46 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  25.84 
 
 
321 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3874  putative F420-dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  32.48 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0173  putative F420-dependent oxidoreductase  35 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  27.18 
 
 
327 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  32.18 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  29.73 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  33.59 
 
 
306 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3680  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  30 
 
 
322 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  32.56 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>