More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0547 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0547  inner-membrane translocator  100 
 
 		 321 aa  613  1e-175  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182866  hitchhiker  0.0000429252 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1522  inner-membrane translocator  94.39 
 
 		 321 aa  546  1e-154  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000276655  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0846  inner-membrane translocator  78.19 
 
 		 321 aa  496  1e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.643705 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0448  inner-membrane translocator  77.26 
 
 		 320 aa  472  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 325 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5640  inner-membrane translocator  34.12 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2142  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 324 aa  109  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  34.6 
 
 		 830 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0006  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  hitchhiker  0.0000215345 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  34.68 
 
 		 823 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 331 aa  99.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000769607  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 357 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  36.03 
 
 		 823 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 389 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  30.54 
 
 		 297 aa  99.8  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.18 
 
 		 389 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.27 
 
 		 389 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.7 
 
 		 389 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 389 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  33.33 
 
 		 593 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7433  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  31.29 
 
 		 363 aa  97.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 389 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 389 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 389 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 339 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 389 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 435 aa  96.3  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 389 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 389 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 389 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 389 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.96 
 
 		 389 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 389 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 389 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.05 
 
 		 315 aa  95.9  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1894  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 454 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.0546266 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0462  inner-membrane translocator  27.53 
 
 		 331 aa  95.9  9e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 415 aa  95.9  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  35.36 
 
 		 389 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  33.86 
 
 		 358 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 384 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  29.03 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  32.33 
 
 		 378 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 407 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 389 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 389 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 399 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  29.77 
 
 		 616 aa  93.6  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 452 aa  93.6  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.5 
 
 		 423 aa  93.2  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 398 aa  93.6  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 337 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 328 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 337 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 352 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  28.03 
 
 		 324 aa  92.8  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2007  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.58 
 
 		 357 aa  92.4  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.67 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  26.94 
 
 		 372 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3000  inner-membrane translocator  34 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.463363  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1872  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.22 
 
 		 427 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  0.0232173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  30 
 
 		 333 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2554  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  25.79 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2727  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 385 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2550  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 370 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2203  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.67 
 
 		 418 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1124  putative transport system permease protein  34.77 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101102  normal  0.0627537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3967  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.36 
 
 		 418 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  32.73 
 
 		 593 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.47 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.36 
 
 		 418 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.35 
 
 		 412 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.36 
 
 		 418 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2707  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 375 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 344 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2317  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 375 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156371  hitchhiker  0.00287138 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3171  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 363 aa  89.4  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.37 
 
 		 418 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4911  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 316 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.62 
 
 		 427 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>