More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3900 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  100 
 
 
568 aa  1142    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  50 
 
 
600 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  47.54 
 
 
611 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  46.67 
 
 
603 aa  494  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  45.36 
 
 
600 aa  488  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  44.96 
 
 
605 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  43.86 
 
 
599 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  42.28 
 
 
628 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  40.87 
 
 
583 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  39.59 
 
 
596 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  39.78 
 
 
586 aa  375  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  36.41 
 
 
625 aa  375  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  39.59 
 
 
596 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  40.64 
 
 
583 aa  363  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  39.42 
 
 
585 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  33.1 
 
 
599 aa  344  2e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  35.22 
 
 
594 aa  342  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  35.98 
 
 
614 aa  339  8e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  34.63 
 
 
600 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  34.78 
 
 
613 aa  305  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4465  ABC transporter related  38.8 
 
 
585 aa  302  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269199 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  35.56 
 
 
571 aa  300  6e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.54 
 
 
601 aa  293  4e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  32.72 
 
 
601 aa  293  4e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  29.88 
 
 
564 aa  280  5e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  30.93 
 
 
599 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.03 
 
 
564 aa  270  4e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  31.38 
 
 
610 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  30.13 
 
 
610 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  31.43 
 
 
611 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  26.84 
 
 
586 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.86 
 
 
564 aa  255  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.68 
 
 
564 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  31.12 
 
 
611 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  27.75 
 
 
576 aa  247  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  30.48 
 
 
612 aa  239  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  32.65 
 
 
606 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  28.44 
 
 
586 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  33.73 
 
 
603 aa  228  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  26.01 
 
 
552 aa  224  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25671  putative ABC transporter  32.32 
 
 
605 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  31.74 
 
 
626 aa  212  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0198  ATPase  29.73 
 
 
613 aa  208  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.312948  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  29.58 
 
 
610 aa  204  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  29.2 
 
 
600 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  27.92 
 
 
607 aa  194  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  29.9 
 
 
610 aa  193  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.69 
 
 
586 aa  193  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.04 
 
 
579 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  28.65 
 
 
613 aa  190  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  28.6 
 
 
599 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  27.09 
 
 
676 aa  187  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.55 
 
 
632 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  28.24 
 
 
596 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.47 
 
 
641 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  41.28 
 
 
647 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  41.7 
 
 
644 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  43.67 
 
 
640 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  27.85 
 
 
618 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  41.43 
 
 
634 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  29.01 
 
 
606 aa  183  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  41.53 
 
 
663 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  43.13 
 
 
655 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  28.6 
 
 
594 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  41.53 
 
 
662 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1949  ABC transporter related  32.37 
 
 
600 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867267  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  45.74 
 
 
552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  26.31 
 
 
610 aa  181  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  27.76 
 
 
580 aa  181  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  27.22 
 
 
588 aa  181  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.25 
 
 
574 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.42 
 
 
608 aa  180  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  40.49 
 
 
598 aa  180  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  27.82 
 
 
625 aa  180  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  27.2 
 
 
655 aa  180  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.55 
 
 
639 aa  180  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  28.51 
 
 
612 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4185  ABC transporter related  27.79 
 
 
654 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903444 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  28.51 
 
 
612 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.03 
 
 
574 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0964  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.62 
 
 
601 aa  178  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.519828  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1218  ABC transporter related  28.4 
 
 
618 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0802888  normal  0.120203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  29.94 
 
 
624 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.16 
 
 
627 aa  177  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  28.54 
 
 
607 aa  178  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3504  multidrug ABC transporter ATPase/permease  28.16 
 
 
657 aa  178  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  33.97 
 
 
643 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  29.4 
 
 
592 aa  177  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  41.86 
 
 
598 aa  177  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  42.22 
 
 
592 aa  177  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  27.73 
 
 
613 aa  176  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2422  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.57 
 
 
601 aa  176  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2492  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.57 
 
 
601 aa  176  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677361  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  41.15 
 
 
629 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  42.37 
 
 
620 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  33.33 
 
 
615 aa  176  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  28.24 
 
 
617 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  45.37 
 
 
619 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  39.64 
 
 
661 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.22 
 
 
597 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>