More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1941 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1941  histidine kinase  100 
 
 
514 aa  978    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.531292  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  60.16 
 
 
472 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  40.95 
 
 
455 aa  324  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  43.12 
 
 
457 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  42.8 
 
 
457 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  42.39 
 
 
454 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 
454 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 
454 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  34.84 
 
 
467 aa  296  7e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.2 
 
 
454 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  39.03 
 
 
471 aa  246  9e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  38.78 
 
 
471 aa  244  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  33.74 
 
 
478 aa  232  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
449 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  36.98 
 
 
478 aa  231  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  36.77 
 
 
449 aa  229  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 
433 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0140  sensor histidine kinase  32.08 
 
 
471 aa  213  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  35.01 
 
 
519 aa  212  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02325  signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
454 aa  209  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280945  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
445 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.52 
 
 
433 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
445 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 
433 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 
448 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  39.29 
 
 
501 aa  204  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03385  sensor histidine kinase  34.12 
 
 
411 aa  203  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367883  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
450 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
448 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
458 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
524 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  39.43 
 
 
448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  39.31 
 
 
438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 
448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 
448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1229  sensor histidine kinase  30.35 
 
 
477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.131746 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1828  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 
466 aa  196  7e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0770919  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
444 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
413 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 
480 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  38.55 
 
 
438 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  38.55 
 
 
438 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
515 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  38.55 
 
 
438 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003618  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
475 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  31.56 
 
 
442 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  38.55 
 
 
438 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  33.47 
 
 
454 aa  194  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  38.55 
 
 
438 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  38.55 
 
 
438 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  38.55 
 
 
438 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
519 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.35 
 
 
513 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  37.36 
 
 
499 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
466 aa  189  9e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00327402  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  36.27 
 
 
505 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  36.27 
 
 
505 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1886  ATPase domain-containing protein  29.68 
 
 
464 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
515 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 
517 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2105  sensor protein YgiY, putative  29.44 
 
 
476 aa  188  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
464 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367152  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  36.27 
 
 
505 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
464 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 
469 aa  188  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  36.53 
 
 
505 aa  187  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2398  histidine kinase  28.78 
 
 
465 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00201135  normal  0.0208658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
465 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290384  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
465 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000014063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  38.53 
 
 
518 aa  186  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  34 
 
 
459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  39.47 
 
 
438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00272877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 
517 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 
517 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  38.44 
 
 
523 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  40.06 
 
 
517 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  38.44 
 
 
817 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  38.76 
 
 
441 aa  183  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  36.73 
 
 
526 aa  181  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
478 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
531 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  32.34 
 
 
467 aa  179  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  34.42 
 
 
443 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
515 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
462 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  34.42 
 
 
444 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.81 
 
 
515 aa  177  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4241  sensor protein QseC  30.47 
 
 
449 aa  176  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
461 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  38.41 
 
 
517 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  34.33 
 
 
517 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4830  two-component regulatory system sensory histidine kinase  31.8 
 
 
457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00276208  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
515 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>