78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1130 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1130  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  793    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  45.87 
 
 
412 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  45.87 
 
 
412 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  40.69 
 
 
436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  32.69 
 
 
498 aa  213  7e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3509  Dienelactone hydrolase  31.03 
 
 
438 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0994  hypothetical protein  31.65 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  30.33 
 
 
460 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1982  hypothetical protein  29.5 
 
 
460 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.900389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1682  hydrolase  29.67 
 
 
460 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.35711  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1708  hydrolase  29.5 
 
 
460 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3820  PGAP1 family protein  33.41 
 
 
485 aa  159  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1904  hypothetical protein  29.36 
 
 
460 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4315  hypothetical protein  30.71 
 
 
460 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1953  hypothetical protein  28.67 
 
 
460 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  30 
 
 
512 aa  156  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  30.56 
 
 
512 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2079  putative hydrolase  30.34 
 
 
512 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1866  hypothetical protein  32.81 
 
 
362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1730  hypothetical protein  32.81 
 
 
362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1906  hypothetical protein  26.88 
 
 
434 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  35.96 
 
 
319 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  28.95 
 
 
517 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  34.01 
 
 
309 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5342  hypothetical protein  24.75 
 
 
423 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764052  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  31.36 
 
 
316 aa  92.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  36.14 
 
 
580 aa  89.7  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07480  hypothetical protein  29.63 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1407  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0821941  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1721  Alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
317 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.78 
 
 
518 aa  80.9  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1852  hypothetical protein  29.41 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1437  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.872938  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1829  alpha/beta fold family hydrolase  28.63 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.174462  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3881  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00418628  normal  0.248118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  25.18 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1881  lysophospholipase-like protein  27.78 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  33.33 
 
 
473 aa  76.6  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  26.21 
 
 
442 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2042  hypothetical protein  28.3 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.429785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  27.98 
 
 
317 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2298  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 
322 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321032  decreased coverage  0.000193345 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  35.03 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  25.09 
 
 
327 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  33.76 
 
 
338 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  33.76 
 
 
339 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  33.76 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1232  alpha/beta fold family hydrolase  29.35 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  34.03 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  34.03 
 
 
342 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  34.03 
 
 
341 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  26.6 
 
 
474 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  32.95 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  27.07 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  31.77 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 
315 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
319 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 
320 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 
309 aa  57.4  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2263  alpha/beta hydrolase  23.31 
 
 
315 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 
424 aa  56.6  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  24.55 
 
 
259 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0299  hypothetical protein  30.51 
 
 
307 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.261674 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
321 aa  53.5  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
274 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  24.28 
 
 
258 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  25.58 
 
 
490 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.24 
 
 
292 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
273 aa  47  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.58 
 
 
261 aa  47  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  22.99 
 
 
592 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1491  hypothetical protein  24.63 
 
 
236 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199591  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3318  hypothetical protein  22.33 
 
 
216 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.329513  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41254  predicted protein  43.28 
 
 
284 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.401564  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2903  hypothetical protein  25 
 
 
212 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 
314 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>