More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0825 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0825  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
446 aa  890    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0472213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0546  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.71 
 
 
449 aa  585  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.614447  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0532  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.93 
 
 
449 aa  584  1e-166  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0112141  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.12 
 
 
451 aa  583  1.0000000000000001e-165  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0230  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.11 
 
 
454 aa  569  1e-161  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.247688  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.31 
 
 
463 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.71 
 
 
470 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.89 
 
 
562 aa  346  5e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.54 
 
 
458 aa  342  9e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.67 
 
 
470 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.24 
 
 
465 aa  323  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.04 
 
 
465 aa  323  5e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.02 
 
 
465 aa  320  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.55 
 
 
473 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.87 
 
 
463 aa  319  6e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.79 
 
 
458 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 
462 aa  317  4e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.47 
 
 
467 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.26 
 
 
450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.66 
 
 
470 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.93 
 
 
459 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.33 
 
 
470 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  41 
 
 
461 aa  312  9e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.2 
 
 
459 aa  312  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.25 
 
 
468 aa  310  2.9999999999999997e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.6 
 
 
459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.93 
 
 
459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  41.38 
 
 
464 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.5 
 
 
468 aa  306  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.56 
 
 
470 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.56 
 
 
470 aa  306  6e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.56 
 
 
470 aa  306  6e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.56 
 
 
470 aa  306  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.77 
 
 
461 aa  306  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.77 
 
 
467 aa  305  7e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.92 
 
 
460 aa  305  7e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.26 
 
 
581 aa  305  7e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.75 
 
 
459 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.33 
 
 
470 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.75 
 
 
459 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.7 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.56 
 
 
470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.56 
 
 
470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.56 
 
 
470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.11 
 
 
470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.11 
 
 
470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  40.58 
 
 
468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.11 
 
 
470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.15 
 
 
469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.28 
 
 
585 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.71 
 
 
468 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.8 
 
 
459 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.48 
 
 
459 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.31 
 
 
465 aa  302  6.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.58 
 
 
459 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.69 
 
 
462 aa  301  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.24 
 
 
470 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  38.84 
 
 
584 aa  301  1e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.6 
 
 
465 aa  301  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.29 
 
 
473 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.65 
 
 
468 aa  300  3e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.14 
 
 
465 aa  300  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5475  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.56 
 
 
466 aa  299  6e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67474  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
473 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.46 
 
 
472 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.89 
 
 
473 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.03 
 
 
459 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.78 
 
 
468 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.78 
 
 
468 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
473 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
473 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
473 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
473 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
473 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
473 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.37 
 
 
459 aa  298  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.61 
 
 
466 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.77 
 
 
471 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.33 
 
 
464 aa  297  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0745  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.75 
 
 
461 aa  297  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.77 
 
 
464 aa  296  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.07 
 
 
473 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.27 
 
 
473 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
473 aa  296  5e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
473 aa  296  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
473 aa  296  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.48 
 
 
467 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.88 
 
 
479 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.08 
 
 
459 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.2 
 
 
473 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.31 
 
 
474 aa  295  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.25 
 
 
462 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.29 
 
 
491 aa  294  2e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.96 
 
 
477 aa  294  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
468 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.38 
 
 
472 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.36 
 
 
479 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.44 
 
 
471 aa  293  5e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.29 
 
 
473 aa  293  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.77 
 
 
487 aa  292  6e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>